Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOBEC1P41238 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOBEC1P41238 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOBEC1P41238 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
APOBEC1P41238 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
APOBEC1P41238 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
APOBEC1P41238 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
APOBEC1P41238 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
APOBEC1P41238 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
APOBEC1P41238 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
APOBEC1P41238 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
APOBEC1P41238 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
APOBEC1P41238 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
APOBEC1P41238 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
APOBEC1P41238 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOBEC1P41238 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOBEC1P41238 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
APOBEC1P41238 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
APOBEC1P41238 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
APOBEC1P41238 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
APOBEC1P41238 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
APOBEC1P41238 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
APOBEC1P41238 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
APOBEC1P41238 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
APOBEC1P41238 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
APOBEC1P41238 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
APOBEC1P41238 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
APOBEC1P41238 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
APOBEC1P41238 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
APOBEC1P41238 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
APOBEC1P41238 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
APOBEC1P41238 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
APOBEC1P41238 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
APOBEC1P41238 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APOBEC1P41238 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
APOBEC1P41238 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
APOBEC1P41238 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
APOBEC1P41238 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
APOBEC1P41238 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
APOBEC1P41238 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
APOBEC1P41238 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
APOBEC1P41238 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
APOBEC1P41238 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
APOBEC1P41238 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
APOBEC1P41238 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
APOBEC1P41238 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
APOBEC1P41238 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
APOBEC1P41238 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
APOBEC1P41238 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
APOBEC1P41238 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
APOBEC1P41238 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
APOBEC1P41238 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
APOBEC1P41238 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
APOBEC1P41238 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
APOBEC1P41238 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
APOBEC1P41238 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
APOBEC1P41238 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
APOBEC1P41238 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
APOBEC1P41238 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
APOBEC1P41238 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
APOBEC1P41238 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
APOBEC1P41238 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
APOBEC1P41238 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
APOBEC1P41238 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
APOBEC1P41238 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
APOBEC1P41238 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
APOBEC1P41238 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
APOBEC1P41238 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
APOBEC1P41238 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOBEC1P41238 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
APOBEC1P41238 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOBEC1P41238 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOBEC1P41238 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOBEC1P41238 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOBEC1P41238 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOBEC1P41238 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOBEC1P41238 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOBEC1P41238 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOBEC1P41238 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
APOBEC1P41238 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOBEC1P41238 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOBEC1P41238 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOBEC1P41238 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOBEC1P41238 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOBEC1P41238 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOBEC1P41238 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOBEC1P41238 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOBEC1P41238 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOBEC1P41238 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOBEC1P41238 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOBEC1P41238 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOBEC1P41238 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOBEC1P41238 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOBEC1P41238 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOBEC1P41238 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOBEC1P41238 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOBEC1P41238 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOBEC1P41238 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOBEC1P41238 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOBEC1P41238 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms