Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
COPB2P35606 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
COPB2P35606 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
COPB2P35606 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
COPB2P35606 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
COPB2P35606 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
COPB2P35606 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
COPB2P35606 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
COPB2P35606 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
COPB2P35606 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
COPB2P35606 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
COPB2P35606 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
COPB2P35606 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
COPB2P35606 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
COPB2P35606 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
COPB2P35606 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
COPB2P35606 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
COPB2P35606 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
COPB2P35606 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
COPB2P35606 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
COPB2P35606 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
COPB2P35606 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
COPB2P35606 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
COPB2P35606 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
COPB2P35606 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
COPB2P35606 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
COPB2P35606 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
COPB2P35606 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
COPB2P35606 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
COPB2P35606 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
COPB2P35606 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
COPB2P35606 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
COPB2P35606 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
COPB2P35606 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
COPB2P35606 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
COPB2P35606 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
COPB2P35606 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
COPB2P35606 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
COPB2P35606 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
COPB2P35606 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
COPB2P35606 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
COPB2P35606 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
COPB2P35606 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
COPB2P35606 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
COPB2P35606 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
COPB2P35606 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
COPB2P35606 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
COPB2P35606 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
COPB2P35606 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
COPB2P35606 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
COPB2P35606 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
COPB2P35606 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
COPB2P35606 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
COPB2P35606 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
COPB2P35606 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
COPB2P35606 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
COPB2P35606 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
COPB2P35606 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
COPB2P35606 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
COPB2P35606 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
COPB2P35606 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
COPB2P35606 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
COPB2P35606 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
COPB2P35606 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
COPB2P35606 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
COPB2P35606 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
COPB2P35606 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
COPB2P35606 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
COPB2P35606 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
COPB2P35606 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
COPB2P35606 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
COPB2P35606 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
COPB2P35606 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
COPB2P35606 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
COPB2P35606 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
COPB2P35606 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
COPB2P35606 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
COPB2P35606 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
COPB2P35606 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
COPB2P35606 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
COPB2P35606 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
COPB2P35606 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
COPB2P35606 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
COPB2P35606 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
COPB2P35606 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
COPB2P35606 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
COPB2P35606 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
COPB2P35606 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
COPB2P35606 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
COPB2P35606 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
COPB2P35606 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
COPB2P35606 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
COPB2P35606 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
COPB2P35606 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
COPB2P35606 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
COPB2P35606 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
COPB2P35606 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
COPB2P35606 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
COPB2P35606 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
COPB2P35606 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms