Protein–RNA interactions for Protein: P35241

RDX, Radixin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDXP35241 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RDXP35241 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RDXP35241 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RDXP35241 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RDXP35241 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RDXP35241 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RDXP35241 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RDXP35241 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RDXP35241 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RDXP35241 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RDXP35241 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RDXP35241 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RDXP35241 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RDXP35241 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RDXP35241 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RDXP35241 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RDXP35241 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RDXP35241 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RDXP35241 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RDXP35241 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RDXP35241 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RDXP35241 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RDXP35241 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RDXP35241 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RDXP35241 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RDXP35241 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
RDXP35241 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RDXP35241 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RDXP35241 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RDXP35241 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
RDXP35241 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
RDXP35241 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RDXP35241 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RDXP35241 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RDXP35241 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RDXP35241 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RDXP35241 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RDXP35241 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
RDXP35241 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RDXP35241 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RDXP35241 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RDXP35241 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RDXP35241 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RDXP35241 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RDXP35241 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RDXP35241 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RDXP35241 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RDXP35241 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RDXP35241 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RDXP35241 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RDXP35241 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RDXP35241 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RDXP35241 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RDXP35241 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RDXP35241 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
RDXP35241 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RDXP35241 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RDXP35241 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RDXP35241 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
RDXP35241 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RDXP35241 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RDXP35241 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RDXP35241 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RDXP35241 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RDXP35241 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RDXP35241 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RDXP35241 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RDXP35241 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RDXP35241 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RDXP35241 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RDXP35241 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RDXP35241 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RDXP35241 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RDXP35241 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RDXP35241 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RDXP35241 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RDXP35241 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
RDXP35241 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RDXP35241 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RDXP35241 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RDXP35241 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RDXP35241 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RDXP35241 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RDXP35241 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RDXP35241 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RDXP35241 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
RDXP35241 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RDXP35241 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RDXP35241 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RDXP35241 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RDXP35241 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RDXP35241 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RDXP35241 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RDXP35241 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RDXP35241 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RDXP35241 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RDXP35241 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
RDXP35241 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RDXP35241 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RDXP35241 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms