Protein–RNA interactions for Protein: P32926

DSG3, Desmoglein-3, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG3P32926 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
DSG3P32926 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
DSG3P32926 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
DSG3P32926 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
DSG3P32926 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
DSG3P32926 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
DSG3P32926 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
DSG3P32926 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
DSG3P32926 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
DSG3P32926 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
DSG3P32926 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
DSG3P32926 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
DSG3P32926 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
DSG3P32926 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
DSG3P32926 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
DSG3P32926 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
DSG3P32926 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
DSG3P32926 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
DSG3P32926 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
DSG3P32926 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
DSG3P32926 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
DSG3P32926 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
DSG3P32926 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
DSG3P32926 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
DSG3P32926 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
DSG3P32926 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
DSG3P32926 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
DSG3P32926 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
DSG3P32926 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
DSG3P32926 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
DSG3P32926 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
DSG3P32926 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
DSG3P32926 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
DSG3P32926 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
DSG3P32926 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
DSG3P32926 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
DSG3P32926 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
DSG3P32926 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
DSG3P32926 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
DSG3P32926 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
DSG3P32926 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
DSG3P32926 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
DSG3P32926 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
DSG3P32926 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
DSG3P32926 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
DSG3P32926 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
DSG3P32926 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
DSG3P32926 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
DSG3P32926 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
DSG3P32926 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
DSG3P32926 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
DSG3P32926 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
DSG3P32926 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
DSG3P32926 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
DSG3P32926 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
DSG3P32926 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
DSG3P32926 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
DSG3P32926 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
DSG3P32926 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
DSG3P32926 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
DSG3P32926 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
DSG3P32926 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
DSG3P32926 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
DSG3P32926 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
DSG3P32926 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
DSG3P32926 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
DSG3P32926 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
DSG3P32926 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
DSG3P32926 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
DSG3P32926 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
DSG3P32926 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
DSG3P32926 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
DSG3P32926 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
DSG3P32926 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
DSG3P32926 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
DSG3P32926 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.38
DSG3P32926 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
DSG3P32926 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
DSG3P32926 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
DSG3P32926 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
DSG3P32926 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
DSG3P32926 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
DSG3P32926 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
DSG3P32926 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
DSG3P32926 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
DSG3P32926 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
DSG3P32926 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
DSG3P32926 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
DSG3P32926 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
DSG3P32926 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
DSG3P32926 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
DSG3P32926 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
DSG3P32926 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
DSG3P32926 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
DSG3P32926 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
DSG3P32926 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
DSG3P32926 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
DSG3P32926 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
DSG3P32926 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
DSG3P32926 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms