Protein–RNA interactions for Protein: P28329

CHAT, Choline O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHATP28329 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHATP28329 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHATP28329 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHATP28329 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHATP28329 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHATP28329 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHATP28329 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHATP28329 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHATP28329 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHATP28329 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHATP28329 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHATP28329 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHATP28329 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHATP28329 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHATP28329 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHATP28329 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHATP28329 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHATP28329 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHATP28329 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHATP28329 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHATP28329 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHATP28329 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHATP28329 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHATP28329 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHATP28329 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHATP28329 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHATP28329 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHATP28329 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHATP28329 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHATP28329 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHATP28329 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CHATP28329 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHATP28329 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHATP28329 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHATP28329 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHATP28329 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHATP28329 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CHATP28329 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHATP28329 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHATP28329 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHATP28329 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHATP28329 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHATP28329 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHATP28329 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHATP28329 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHATP28329 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHATP28329 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHATP28329 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHATP28329 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHATP28329 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHATP28329 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHATP28329 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHATP28329 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHATP28329 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHATP28329 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHATP28329 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHATP28329 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHATP28329 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHATP28329 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHATP28329 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHATP28329 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHATP28329 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHATP28329 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHATP28329 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHATP28329 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHATP28329 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHATP28329 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CHATP28329 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHATP28329 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHATP28329 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CHATP28329 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHATP28329 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHATP28329 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHATP28329 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHATP28329 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHATP28329 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHATP28329 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHATP28329 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHATP28329 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHATP28329 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CHATP28329 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHATP28329 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHATP28329 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHATP28329 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHATP28329 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHATP28329 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHATP28329 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHATP28329 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHATP28329 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHATP28329 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHATP28329 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHATP28329 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHATP28329 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHATP28329 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHATP28329 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CHATP28329 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHATP28329 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHATP28329 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHATP28329 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHATP28329 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms