Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSMB9P28065 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSMB9P28065 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSMB9P28065 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSMB9P28065 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSMB9P28065 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PSMB9P28065 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSMB9P28065 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSMB9P28065 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSMB9P28065 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSMB9P28065 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSMB9P28065 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSMB9P28065 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSMB9P28065 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSMB9P28065 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSMB9P28065 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSMB9P28065 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSMB9P28065 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PSMB9P28065 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSMB9P28065 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSMB9P28065 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSMB9P28065 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSMB9P28065 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSMB9P28065 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSMB9P28065 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSMB9P28065 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PSMB9P28065 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSMB9P28065 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSMB9P28065 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSMB9P28065 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSMB9P28065 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSMB9P28065 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSMB9P28065 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSMB9P28065 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSMB9P28065 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSMB9P28065 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSMB9P28065 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSMB9P28065 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PSMB9P28065 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSMB9P28065 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSMB9P28065 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMB9P28065 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMB9P28065 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMB9P28065 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSMB9P28065 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSMB9P28065 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSMB9P28065 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSMB9P28065 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSMB9P28065 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSMB9P28065 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSMB9P28065 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSMB9P28065 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSMB9P28065 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSMB9P28065 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSMB9P28065 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSMB9P28065 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PSMB9P28065 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSMB9P28065 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSMB9P28065 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSMB9P28065 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSMB9P28065 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSMB9P28065 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSMB9P28065 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSMB9P28065 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSMB9P28065 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSMB9P28065 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSMB9P28065 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSMB9P28065 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSMB9P28065 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSMB9P28065 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSMB9P28065 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSMB9P28065 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSMB9P28065 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSMB9P28065 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSMB9P28065 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSMB9P28065 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSMB9P28065 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSMB9P28065 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSMB9P28065 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSMB9P28065 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSMB9P28065 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSMB9P28065 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSMB9P28065 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSMB9P28065 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSMB9P28065 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSMB9P28065 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSMB9P28065 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSMB9P28065 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSMB9P28065 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSMB9P28065 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSMB9P28065 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSMB9P28065 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMB9P28065 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMB9P28065 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMB9P28065 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMB9P28065 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMB9P28065 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMB9P28065 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMB9P28065 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMB9P28065 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.9 ms