Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PSMA3P25788 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PSMA3P25788 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PSMA3P25788 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PSMA3P25788 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PSMA3P25788 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PSMA3P25788 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PSMA3P25788 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PSMA3P25788 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PSMA3P25788 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PSMA3P25788 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
PSMA3P25788 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PSMA3P25788 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PSMA3P25788 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PSMA3P25788 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PSMA3P25788 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PSMA3P25788 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PSMA3P25788 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PSMA3P25788 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PSMA3P25788 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PSMA3P25788 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PSMA3P25788 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PSMA3P25788 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PSMA3P25788 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PSMA3P25788 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PSMA3P25788 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PSMA3P25788 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PSMA3P25788 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PSMA3P25788 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PSMA3P25788 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PSMA3P25788 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PSMA3P25788 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PSMA3P25788 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PSMA3P25788 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PSMA3P25788 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PSMA3P25788 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PSMA3P25788 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PSMA3P25788 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PSMA3P25788 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PSMA3P25788 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PSMA3P25788 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PSMA3P25788 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PSMA3P25788 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PSMA3P25788 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PSMA3P25788 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PSMA3P25788 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PSMA3P25788 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PSMA3P25788 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PSMA3P25788 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PSMA3P25788 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PSMA3P25788 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PSMA3P25788 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PSMA3P25788 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PSMA3P25788 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PSMA3P25788 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PSMA3P25788 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PSMA3P25788 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PSMA3P25788 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PSMA3P25788 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PSMA3P25788 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PSMA3P25788 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PSMA3P25788 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PSMA3P25788 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PSMA3P25788 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PSMA3P25788 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PSMA3P25788 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PSMA3P25788 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PSMA3P25788 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PSMA3P25788 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PSMA3P25788 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PSMA3P25788 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PSMA3P25788 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PSMA3P25788 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PSMA3P25788 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PSMA3P25788 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PSMA3P25788 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PSMA3P25788 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PSMA3P25788 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PSMA3P25788 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PSMA3P25788 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PSMA3P25788 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PSMA3P25788 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PSMA3P25788 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PSMA3P25788 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PSMA3P25788 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PSMA3P25788 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PSMA3P25788 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PSMA3P25788 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PSMA3P25788 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PSMA3P25788 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PSMA3P25788 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PSMA3P25788 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PSMA3P25788 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PSMA3P25788 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PSMA3P25788 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PSMA3P25788 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PSMA3P25788 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PSMA3P25788 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PSMA3P25788 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PSMA3P25788 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms