Protein–RNA interactions for Protein: P23280

CA6, Carbonic anhydrase 6, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA6P23280 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CA6P23280 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CA6P23280 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CA6P23280 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CA6P23280 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CA6P23280 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CA6P23280 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CA6P23280 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CA6P23280 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CA6P23280 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CA6P23280 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CA6P23280 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CA6P23280 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CA6P23280 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CA6P23280 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CA6P23280 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CA6P23280 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CA6P23280 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CA6P23280 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CA6P23280 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CA6P23280 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CA6P23280 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CA6P23280 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CA6P23280 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CA6P23280 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CA6P23280 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CA6P23280 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CA6P23280 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CA6P23280 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CA6P23280 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CA6P23280 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CA6P23280 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CA6P23280 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CA6P23280 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CA6P23280 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CA6P23280 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CA6P23280 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CA6P23280 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CA6P23280 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CA6P23280 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CA6P23280 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CA6P23280 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CA6P23280 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CA6P23280 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CA6P23280 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CA6P23280 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CA6P23280 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CA6P23280 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CA6P23280 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CA6P23280 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CA6P23280 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CA6P23280 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CA6P23280 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CA6P23280 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CA6P23280 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CA6P23280 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CA6P23280 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CA6P23280 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CA6P23280 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CA6P23280 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CA6P23280 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CA6P23280 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CA6P23280 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CA6P23280 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CA6P23280 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CA6P23280 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CA6P23280 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CA6P23280 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CA6P23280 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CA6P23280 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CA6P23280 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CA6P23280 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CA6P23280 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CA6P23280 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CA6P23280 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CA6P23280 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CA6P23280 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CA6P23280 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CA6P23280 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CA6P23280 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CA6P23280 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CA6P23280 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CA6P23280 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CA6P23280 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CA6P23280 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CA6P23280 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CA6P23280 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CA6P23280 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CA6P23280 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CA6P23280 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CA6P23280 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CA6P23280 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CA6P23280 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CA6P23280 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CA6P23280 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CA6P23280 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CA6P23280 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CA6P23280 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CA6P23280 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CA6P23280 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms