Protein–RNA interactions for Protein: P20142

PGC, Gastricsin, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGCP20142 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PGCP20142 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PGCP20142 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PGCP20142 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PGCP20142 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PGCP20142 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PGCP20142 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PGCP20142 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PGCP20142 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PGCP20142 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PGCP20142 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PGCP20142 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PGCP20142 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PGCP20142 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PGCP20142 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PGCP20142 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PGCP20142 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PGCP20142 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PGCP20142 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PGCP20142 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PGCP20142 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PGCP20142 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PGCP20142 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PGCP20142 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PGCP20142 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PGCP20142 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PGCP20142 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PGCP20142 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PGCP20142 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PGCP20142 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PGCP20142 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PGCP20142 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PGCP20142 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PGCP20142 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PGCP20142 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PGCP20142 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PGCP20142 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PGCP20142 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PGCP20142 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PGCP20142 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PGCP20142 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PGCP20142 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PGCP20142 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PGCP20142 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PGCP20142 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PGCP20142 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PGCP20142 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PGCP20142 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PGCP20142 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PGCP20142 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PGCP20142 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PGCP20142 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PGCP20142 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PGCP20142 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PGCP20142 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PGCP20142 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PGCP20142 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PGCP20142 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PGCP20142 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PGCP20142 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PGCP20142 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PGCP20142 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PGCP20142 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PGCP20142 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PGCP20142 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PGCP20142 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PGCP20142 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PGCP20142 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PGCP20142 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PGCP20142 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PGCP20142 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PGCP20142 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PGCP20142 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PGCP20142 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PGCP20142 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PGCP20142 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PGCP20142 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PGCP20142 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PGCP20142 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PGCP20142 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PGCP20142 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PGCP20142 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PGCP20142 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PGCP20142 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PGCP20142 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PGCP20142 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PGCP20142 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PGCP20142 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PGCP20142 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PGCP20142 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PGCP20142 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PGCP20142 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PGCP20142 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PGCP20142 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PGCP20142 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PGCP20142 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PGCP20142 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PGCP20142 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PGCP20142 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PGCP20142 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms