Protein–RNA interactions for Protein: P17038

ZNF43, Zinc finger protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF43P17038 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF43P17038 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF43P17038 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF43P17038 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF43P17038 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF43P17038 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF43P17038 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF43P17038 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF43P17038 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF43P17038 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF43P17038 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF43P17038 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF43P17038 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF43P17038 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF43P17038 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF43P17038 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF43P17038 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF43P17038 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF43P17038 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF43P17038 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF43P17038 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF43P17038 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF43P17038 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF43P17038 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF43P17038 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF43P17038 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF43P17038 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF43P17038 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF43P17038 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZNF43P17038 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZNF43P17038 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF43P17038 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF43P17038 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF43P17038 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF43P17038 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF43P17038 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF43P17038 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF43P17038 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF43P17038 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF43P17038 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF43P17038 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF43P17038 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF43P17038 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF43P17038 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF43P17038 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF43P17038 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF43P17038 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF43P17038 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF43P17038 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF43P17038 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF43P17038 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF43P17038 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZNF43P17038 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF43P17038 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF43P17038 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF43P17038 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF43P17038 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF43P17038 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF43P17038 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF43P17038 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF43P17038 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF43P17038 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF43P17038 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF43P17038 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF43P17038 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF43P17038 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF43P17038 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF43P17038 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF43P17038 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF43P17038 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF43P17038 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF43P17038 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF43P17038 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF43P17038 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF43P17038 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF43P17038 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF43P17038 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF43P17038 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF43P17038 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF43P17038 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF43P17038 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF43P17038 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF43P17038 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF43P17038 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF43P17038 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF43P17038 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF43P17038 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF43P17038 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF43P17038 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF43P17038 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF43P17038 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF43P17038 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF43P17038 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF43P17038 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF43P17038 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF43P17038 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF43P17038 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF43P17038 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF43P17038 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF43P17038 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms