Protein–RNA interactions for Protein: P15428

HPGD, 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase [NAD(+)], humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPGDP15428 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HPGDP15428 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HPGDP15428 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HPGDP15428 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HPGDP15428 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HPGDP15428 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HPGDP15428 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HPGDP15428 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
HPGDP15428 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HPGDP15428 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HPGDP15428 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HPGDP15428 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HPGDP15428 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HPGDP15428 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HPGDP15428 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HPGDP15428 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HPGDP15428 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HPGDP15428 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HPGDP15428 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HPGDP15428 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HPGDP15428 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HPGDP15428 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HPGDP15428 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HPGDP15428 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
HPGDP15428 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
HPGDP15428 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HPGDP15428 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
HPGDP15428 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HPGDP15428 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HPGDP15428 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HPGDP15428 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HPGDP15428 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
HPGDP15428 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HPGDP15428 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HPGDP15428 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HPGDP15428 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
HPGDP15428 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HPGDP15428 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HPGDP15428 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HPGDP15428 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HPGDP15428 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HPGDP15428 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
HPGDP15428 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HPGDP15428 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HPGDP15428 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HPGDP15428 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HPGDP15428 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HPGDP15428 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HPGDP15428 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HPGDP15428 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HPGDP15428 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HPGDP15428 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
HPGDP15428 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
HPGDP15428 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HPGDP15428 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HPGDP15428 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HPGDP15428 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HPGDP15428 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HPGDP15428 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HPGDP15428 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HPGDP15428 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HPGDP15428 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HPGDP15428 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HPGDP15428 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HPGDP15428 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HPGDP15428 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HPGDP15428 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HPGDP15428 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HPGDP15428 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HPGDP15428 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HPGDP15428 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HPGDP15428 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HPGDP15428 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HPGDP15428 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HPGDP15428 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
HPGDP15428 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HPGDP15428 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HPGDP15428 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HPGDP15428 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HPGDP15428 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HPGDP15428 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HPGDP15428 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HPGDP15428 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HPGDP15428 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HPGDP15428 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HPGDP15428 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HPGDP15428 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HPGDP15428 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HPGDP15428 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HPGDP15428 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
HPGDP15428 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HPGDP15428 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HPGDP15428 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HPGDP15428 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HPGDP15428 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HPGDP15428 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HPGDP15428 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HPGDP15428 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HPGDP15428 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HPGDP15428 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms