Protein–RNA interactions for Protein: P12830

CDH1, Cadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1P12830 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDH1P12830 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDH1P12830 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDH1P12830 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDH1P12830 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDH1P12830 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDH1P12830 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDH1P12830 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDH1P12830 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CDH1P12830 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDH1P12830 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDH1P12830 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDH1P12830 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CDH1P12830 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDH1P12830 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDH1P12830 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDH1P12830 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDH1P12830 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDH1P12830 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDH1P12830 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDH1P12830 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDH1P12830 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDH1P12830 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CDH1P12830 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CDH1P12830 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDH1P12830 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDH1P12830 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDH1P12830 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDH1P12830 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDH1P12830 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDH1P12830 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDH1P12830 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDH1P12830 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDH1P12830 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDH1P12830 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDH1P12830 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDH1P12830 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDH1P12830 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDH1P12830 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDH1P12830 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CDH1P12830 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDH1P12830 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDH1P12830 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDH1P12830 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CDH1P12830 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDH1P12830 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDH1P12830 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDH1P12830 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDH1P12830 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDH1P12830 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDH1P12830 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDH1P12830 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDH1P12830 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDH1P12830 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDH1P12830 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDH1P12830 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDH1P12830 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CDH1P12830 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDH1P12830 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDH1P12830 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDH1P12830 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDH1P12830 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDH1P12830 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDH1P12830 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDH1P12830 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDH1P12830 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDH1P12830 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDH1P12830 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CDH1P12830 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CDH1P12830 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CDH1P12830 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDH1P12830 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDH1P12830 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDH1P12830 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDH1P12830 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDH1P12830 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDH1P12830 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDH1P12830 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDH1P12830 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDH1P12830 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDH1P12830 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CDH1P12830 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CDH1P12830 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CDH1P12830 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDH1P12830 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDH1P12830 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDH1P12830 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDH1P12830 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDH1P12830 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDH1P12830 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDH1P12830 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDH1P12830 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDH1P12830 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDH1P12830 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDH1P12830 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDH1P12830 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDH1P12830 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDH1P12830 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDH1P12830 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDH1P12830 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms