Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.71■■■■■ 5.07
TOP2AP11388 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC46.7■■■■■ 5.07
TOP2AP11388 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC46.69■■■■■ 5.07
TOP2AP11388 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.68■■■■■ 5.06
TOP2AP11388 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.68■■■■■ 5.06
TOP2AP11388 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC46.68■■■■■ 5.06
TOP2AP11388 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC46.67■■■■■ 5.06
TOP2AP11388 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.66■■■■■ 5.06
TOP2AP11388 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.66■■■■■ 5.06
TOP2AP11388 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC46.66■■■■■ 5.06
TOP2AP11388 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC46.64■■■■■ 5.06
TOP2AP11388 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC46.64■■■■■ 5.06
TOP2AP11388 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC46.64■■■■■ 5.06
TOP2AP11388 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC46.64■■■■■ 5.06
TOP2AP11388 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC46.63■■■■■ 5.05
TOP2AP11388 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC46.63■■■■■ 5.05
TOP2AP11388 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.62■■■■■ 5.05
TOP2AP11388 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.62■■■■■ 5.05
TOP2AP11388 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC46.62■■■■■ 5.05
TOP2AP11388 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC46.61■■■■■ 5.05
TOP2AP11388 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC46.61■■■■■ 5.05
TOP2AP11388 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC46.61■■■■■ 5.05
TOP2AP11388 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.6■■■■■ 5.05
TOP2AP11388 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC46.6■■■■■ 5.05
TOP2AP11388 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.59■■■■■ 5.05
TOP2AP11388 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC46.59■■■■■ 5.05
TOP2AP11388 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC46.59■■■■■ 5.05
TOP2AP11388 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC46.59■■■■■ 5.05
TOP2AP11388 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC46.59■■■■■ 5.05
TOP2AP11388 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC46.59■■■■■ 5.05
TOP2AP11388 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC46.59■■■■■ 5.05
TOP2AP11388 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.58■■■■■ 5.05
TOP2AP11388 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.57■■■■■ 5.05
TOP2AP11388 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC46.56■■■■■ 5.04
TOP2AP11388 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC46.56■■■■■ 5.04
TOP2AP11388 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.55■■■■■ 5.04
TOP2AP11388 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC46.55■■■■■ 5.04
TOP2AP11388 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC46.54■■■■■ 5.04
TOP2AP11388 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.54■■■■■ 5.04
TOP2AP11388 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.54■■■■■ 5.04
TOP2AP11388 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC46.54■■■■■ 5.04
TOP2AP11388 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC46.51■■■■■ 5.04
TOP2AP11388 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.49■■■■■ 5.03
TOP2AP11388 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC46.48■■■■■ 5.03
TOP2AP11388 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC46.47■■■■■ 5.03
TOP2AP11388 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.45■■■■■ 5.03
TOP2AP11388 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC46.44■■■■■ 5.03
TOP2AP11388 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.44■■■■■ 5.03
TOP2AP11388 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.44■■■■■ 5.02
TOP2AP11388 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC46.44■■■■■ 5.02
TOP2AP11388 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC46.42■■■■■ 5.02
TOP2AP11388 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC46.41■■■■■ 5.02
TOP2AP11388 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC46.39■■■■■ 5.02
TOP2AP11388 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.38■■■■■ 5.02
TOP2AP11388 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC46.38■■■■■ 5.01
TOP2AP11388 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC46.37■■■■■ 5.01
TOP2AP11388 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.34■■■■■ 5.01
TOP2AP11388 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC46.34■■■■■ 5.01
TOP2AP11388 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC46.32■■■■■ 5.01
TOP2AP11388 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC46.31■■■■■ 5
TOP2AP11388 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC46.29■■■■■ 5
TOP2AP11388 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.28■■■■■ 5
TOP2AP11388 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC46.28■■■■■ 5
TOP2AP11388 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.28■■■■■ 5
TOP2AP11388 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.27■■■■■ 5
TOP2AP11388 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.27■■■■■ 5
TOP2AP11388 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC46.27■■■■■ 5
TOP2AP11388 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC46.27■■■■■ 5
TOP2AP11388 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC46.27■■■■■ 5
TOP2AP11388 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.27■■■■■ 5
TOP2AP11388 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.26■■■■■ 5
TOP2AP11388 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.26■■■■■ 5
TOP2AP11388 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC46.25■■■■■ 5
TOP2AP11388 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC46.25■■■■■ 4.99
TOP2AP11388 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC46.23■■■■■ 4.99
TOP2AP11388 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC46.23■■■■■ 4.99
TOP2AP11388 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.23■■■■■ 4.99
TOP2AP11388 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.22■■■■■ 4.99
TOP2AP11388 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC46.21■■■■■ 4.99
TOP2AP11388 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.21■■■■■ 4.99
TOP2AP11388 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC46.2■■■■■ 4.99
TOP2AP11388 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.2■■■■■ 4.99
TOP2AP11388 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC46.2■■■■■ 4.99
TOP2AP11388 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC46.19■■■■■ 4.99
TOP2AP11388 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC46.19■■■■■ 4.99
TOP2AP11388 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC46.19■■■■■ 4.98
TOP2AP11388 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC46.18■■■■■ 4.98
TOP2AP11388 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC46.17■■■■■ 4.98
TOP2AP11388 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC46.17■■■■■ 4.98
TOP2AP11388 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC46.17■■■■■ 4.98
TOP2AP11388 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.16■■■■■ 4.98
TOP2AP11388 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.16■■■■■ 4.98
TOP2AP11388 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.16■■■■■ 4.98
TOP2AP11388 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.15■■■■■ 4.98
TOP2AP11388 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC46.15■■■■■ 4.98
TOP2AP11388 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC46.14■■■■■ 4.98
TOP2AP11388 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.13■■■■■ 4.97
TOP2AP11388 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.12■■■■■ 4.97
TOP2AP11388 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC46.12■■■■■ 4.97
TOP2AP11388 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC46.1■■■■■ 4.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms