Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC192P0DO97 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC192P0DO97 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC192P0DO97 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC192P0DO97 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC192P0DO97 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC192P0DO97 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC192P0DO97 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC192P0DO97 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC192P0DO97 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC192P0DO97 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC192P0DO97 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC192P0DO97 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC192P0DO97 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC192P0DO97 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC192P0DO97 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC192P0DO97 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC192P0DO97 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC192P0DO97 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC192P0DO97 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC192P0DO97 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC192P0DO97 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC192P0DO97 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC192P0DO97 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC192P0DO97 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC192P0DO97 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC192P0DO97 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC192P0DO97 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC192P0DO97 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC192P0DO97 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC192P0DO97 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC192P0DO97 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.28
CCDC192P0DO97 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
CCDC192P0DO97 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
CCDC192P0DO97 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC192P0DO97 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC192P0DO97 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC192P0DO97 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC192P0DO97 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC192P0DO97 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC192P0DO97 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC192P0DO97 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC192P0DO97 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC192P0DO97 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC192P0DO97 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC192P0DO97 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC192P0DO97 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC192P0DO97 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC192P0DO97 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC192P0DO97 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC192P0DO97 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC192P0DO97 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC192P0DO97 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC192P0DO97 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC192P0DO97 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC192P0DO97 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC192P0DO97 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CCDC192P0DO97 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CCDC192P0DO97 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCDC192P0DO97 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCDC192P0DO97 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCDC192P0DO97 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC192P0DO97 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC192P0DO97 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC192P0DO97 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC192P0DO97 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC192P0DO97 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC192P0DO97 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC192P0DO97 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC192P0DO97 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC192P0DO97 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC192P0DO97 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC192P0DO97 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC192P0DO97 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC192P0DO97 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC192P0DO97 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC192P0DO97 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC192P0DO97 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC192P0DO97 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC192P0DO97 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC192P0DO97 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC192P0DO97 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC192P0DO97 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC192P0DO97 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC192P0DO97 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC192P0DO97 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC192P0DO97 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC192P0DO97 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC192P0DO97 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC192P0DO97 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC192P0DO97 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC192P0DO97 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC192P0DO97 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC192P0DO97 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC192P0DO97 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC192P0DO97 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC192P0DO97 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC192P0DO97 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC192P0DO97 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC192P0DO97 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms