Protein–RNA interactions for Protein: P0DI82

TRAPPC2B, Trafficking protein particle complex subunit 2B, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2BP0DI82 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAPPC2BP0DI82 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAPPC2BP0DI82 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAPPC2BP0DI82 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAPPC2BP0DI82 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAPPC2BP0DI82 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAPPC2BP0DI82 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAPPC2BP0DI82 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAPPC2BP0DI82 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAPPC2BP0DI82 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAPPC2BP0DI82 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAPPC2BP0DI82 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAPPC2BP0DI82 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAPPC2BP0DI82 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
TRAPPC2BP0DI82 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAPPC2BP0DI82 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAPPC2BP0DI82 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAPPC2BP0DI82 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAPPC2BP0DI82 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAPPC2BP0DI82 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAPPC2BP0DI82 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAPPC2BP0DI82 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAPPC2BP0DI82 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC2BP0DI82 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC2BP0DI82 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC2BP0DI82 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC2BP0DI82 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAPPC2BP0DI82 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAPPC2BP0DI82 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAPPC2BP0DI82 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAPPC2BP0DI82 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAPPC2BP0DI82 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAPPC2BP0DI82 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAPPC2BP0DI82 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAPPC2BP0DI82 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAPPC2BP0DI82 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAPPC2BP0DI82 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAPPC2BP0DI82 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAPPC2BP0DI82 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAPPC2BP0DI82 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAPPC2BP0DI82 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAPPC2BP0DI82 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC2BP0DI82 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC2BP0DI82 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAPPC2BP0DI82 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAPPC2BP0DI82 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC2BP0DI82 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC2BP0DI82 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAPPC2BP0DI82 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAPPC2BP0DI82 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAPPC2BP0DI82 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAPPC2BP0DI82 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC2BP0DI82 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC2BP0DI82 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC2BP0DI82 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC2BP0DI82 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC2BP0DI82 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC2BP0DI82 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAPPC2BP0DI82 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAPPC2BP0DI82 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC2BP0DI82 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC2BP0DI82 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC2BP0DI82 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC2BP0DI82 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC2BP0DI82 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC2BP0DI82 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC2BP0DI82 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC2BP0DI82 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC2BP0DI82 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAPPC2BP0DI82 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAPPC2BP0DI82 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAPPC2BP0DI82 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAPPC2BP0DI82 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAPPC2BP0DI82 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAPPC2BP0DI82 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAPPC2BP0DI82 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAPPC2BP0DI82 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAPPC2BP0DI82 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC2BP0DI82 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC2BP0DI82 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC2BP0DI82 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRAPPC2BP0DI82 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAPPC2BP0DI82 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAPPC2BP0DI82 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAPPC2BP0DI82 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAPPC2BP0DI82 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAPPC2BP0DI82 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAPPC2BP0DI82 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAPPC2BP0DI82 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAPPC2BP0DI82 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC2BP0DI82 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC2BP0DI82 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC2BP0DI82 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC2BP0DI82 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC2BP0DI82 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC2BP0DI82 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC2BP0DI82 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC2BP0DI82 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC2BP0DI82 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC2BP0DI82 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms