Protein–RNA interactions for Protein: P08574

CYC1, Cytochrome c1, heme protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYC1P08574 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYC1P08574 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CYC1P08574 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CYC1P08574 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CYC1P08574 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CYC1P08574 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CYC1P08574 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CYC1P08574 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CYC1P08574 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CYC1P08574 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CYC1P08574 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYC1P08574 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYC1P08574 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYC1P08574 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYC1P08574 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CYC1P08574 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CYC1P08574 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CYC1P08574 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYC1P08574 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYC1P08574 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYC1P08574 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYC1P08574 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYC1P08574 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYC1P08574 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYC1P08574 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYC1P08574 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYC1P08574 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYC1P08574 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYC1P08574 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYC1P08574 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYC1P08574 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYC1P08574 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYC1P08574 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYC1P08574 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYC1P08574 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYC1P08574 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYC1P08574 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CYC1P08574 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CYC1P08574 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CYC1P08574 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CYC1P08574 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CYC1P08574 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CYC1P08574 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYC1P08574 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CYC1P08574 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CYC1P08574 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CYC1P08574 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CYC1P08574 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CYC1P08574 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CYC1P08574 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CYC1P08574 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CYC1P08574 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CYC1P08574 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CYC1P08574 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CYC1P08574 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CYC1P08574 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CYC1P08574 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CYC1P08574 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CYC1P08574 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CYC1P08574 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CYC1P08574 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CYC1P08574 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CYC1P08574 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CYC1P08574 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CYC1P08574 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CYC1P08574 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CYC1P08574 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CYC1P08574 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CYC1P08574 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CYC1P08574 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CYC1P08574 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CYC1P08574 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CYC1P08574 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYC1P08574 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYC1P08574 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYC1P08574 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CYC1P08574 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CYC1P08574 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CYC1P08574 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CYC1P08574 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CYC1P08574 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CYC1P08574 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CYC1P08574 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CYC1P08574 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CYC1P08574 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYC1P08574 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYC1P08574 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYC1P08574 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYC1P08574 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYC1P08574 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYC1P08574 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYC1P08574 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYC1P08574 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYC1P08574 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYC1P08574 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CYC1P08574 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYC1P08574 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CYC1P08574 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CYC1P08574 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CYC1P08574 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms