Protein–RNA interactions for Protein: P05549

TFAP2A, Transcription factor AP-2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAP2AP05549 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TFAP2AP05549 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TFAP2AP05549 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TFAP2AP05549 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TFAP2AP05549 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TFAP2AP05549 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TFAP2AP05549 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TFAP2AP05549 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TFAP2AP05549 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TFAP2AP05549 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TFAP2AP05549 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TFAP2AP05549 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TFAP2AP05549 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TFAP2AP05549 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TFAP2AP05549 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TFAP2AP05549 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TFAP2AP05549 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TFAP2AP05549 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TFAP2AP05549 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TFAP2AP05549 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TFAP2AP05549 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TFAP2AP05549 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TFAP2AP05549 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TFAP2AP05549 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TFAP2AP05549 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TFAP2AP05549 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TFAP2AP05549 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TFAP2AP05549 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TFAP2AP05549 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TFAP2AP05549 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TFAP2AP05549 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TFAP2AP05549 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TFAP2AP05549 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TFAP2AP05549 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TFAP2AP05549 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TFAP2AP05549 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TFAP2AP05549 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TFAP2AP05549 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TFAP2AP05549 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TFAP2AP05549 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TFAP2AP05549 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TFAP2AP05549 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TFAP2AP05549 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TFAP2AP05549 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TFAP2AP05549 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TFAP2AP05549 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TFAP2AP05549 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TFAP2AP05549 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TFAP2AP05549 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TFAP2AP05549 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TFAP2AP05549 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TFAP2AP05549 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TFAP2AP05549 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TFAP2AP05549 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TFAP2AP05549 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TFAP2AP05549 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TFAP2AP05549 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TFAP2AP05549 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TFAP2AP05549 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TFAP2AP05549 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TFAP2AP05549 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TFAP2AP05549 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TFAP2AP05549 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TFAP2AP05549 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TFAP2AP05549 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TFAP2AP05549 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TFAP2AP05549 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TFAP2AP05549 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TFAP2AP05549 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TFAP2AP05549 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TFAP2AP05549 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TFAP2AP05549 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TFAP2AP05549 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TFAP2AP05549 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TFAP2AP05549 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TFAP2AP05549 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TFAP2AP05549 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TFAP2AP05549 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TFAP2AP05549 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TFAP2AP05549 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TFAP2AP05549 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TFAP2AP05549 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TFAP2AP05549 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TFAP2AP05549 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TFAP2AP05549 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TFAP2AP05549 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TFAP2AP05549 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TFAP2AP05549 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TFAP2AP05549 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TFAP2AP05549 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TFAP2AP05549 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TFAP2AP05549 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TFAP2AP05549 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TFAP2AP05549 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TFAP2AP05549 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TFAP2AP05549 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TFAP2AP05549 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TFAP2AP05549 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TFAP2AP05549 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TFAP2AP05549 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85 ms