Protein–RNA interactions for Protein: P05549

TFAP2A, Transcription factor AP-2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAP2AP05549 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC32.15■■■□□ 2.74
TFAP2AP05549 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC31.24■■■□□ 2.59
TFAP2AP05549 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
TFAP2AP05549 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
TFAP2AP05549 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
TFAP2AP05549 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
TFAP2AP05549 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
TFAP2AP05549 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TFAP2AP05549 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TFAP2AP05549 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TFAP2AP05549 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TFAP2AP05549 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TFAP2AP05549 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TFAP2AP05549 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TFAP2AP05549 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TFAP2AP05549 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TFAP2AP05549 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TFAP2AP05549 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TFAP2AP05549 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TFAP2AP05549 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TFAP2AP05549 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TFAP2AP05549 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TFAP2AP05549 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TFAP2AP05549 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
TFAP2AP05549 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TFAP2AP05549 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TFAP2AP05549 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TFAP2AP05549 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TFAP2AP05549 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TFAP2AP05549 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TFAP2AP05549 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TFAP2AP05549 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TFAP2AP05549 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TFAP2AP05549 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TFAP2AP05549 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TFAP2AP05549 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TFAP2AP05549 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TFAP2AP05549 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TFAP2AP05549 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TFAP2AP05549 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TFAP2AP05549 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TFAP2AP05549 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TFAP2AP05549 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TFAP2AP05549 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TFAP2AP05549 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TFAP2AP05549 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TFAP2AP05549 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TFAP2AP05549 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TFAP2AP05549 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TFAP2AP05549 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TFAP2AP05549 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TFAP2AP05549 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TFAP2AP05549 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TFAP2AP05549 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TFAP2AP05549 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TFAP2AP05549 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TFAP2AP05549 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TFAP2AP05549 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TFAP2AP05549 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TFAP2AP05549 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TFAP2AP05549 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TFAP2AP05549 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TFAP2AP05549 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TFAP2AP05549 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TFAP2AP05549 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TFAP2AP05549 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
TFAP2AP05549 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TFAP2AP05549 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TFAP2AP05549 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TFAP2AP05549 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TFAP2AP05549 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TFAP2AP05549 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TFAP2AP05549 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TFAP2AP05549 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TFAP2AP05549 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TFAP2AP05549 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TFAP2AP05549 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TFAP2AP05549 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TFAP2AP05549 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TFAP2AP05549 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TFAP2AP05549 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TFAP2AP05549 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TFAP2AP05549 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TFAP2AP05549 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TFAP2AP05549 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
TFAP2AP05549 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TFAP2AP05549 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TFAP2AP05549 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TFAP2AP05549 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TFAP2AP05549 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TFAP2AP05549 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TFAP2AP05549 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TFAP2AP05549 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TFAP2AP05549 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.92
TFAP2AP05549 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TFAP2AP05549 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TFAP2AP05549 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TFAP2AP05549 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TFAP2AP05549 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TFAP2AP05549 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms