Protein–RNA interactions for Protein: P02654

APOC1, Apolipoprotein C-I, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC1P02654 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOC1P02654 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOC1P02654 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOC1P02654 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOC1P02654 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOC1P02654 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOC1P02654 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOC1P02654 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOC1P02654 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOC1P02654 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOC1P02654 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOC1P02654 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOC1P02654 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
APOC1P02654 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOC1P02654 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
APOC1P02654 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
APOC1P02654 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
APOC1P02654 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
APOC1P02654 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
APOC1P02654 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOC1P02654 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOC1P02654 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOC1P02654 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APOC1P02654 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOC1P02654 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOC1P02654 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOC1P02654 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
APOC1P02654 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOC1P02654 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOC1P02654 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOC1P02654 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOC1P02654 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOC1P02654 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
APOC1P02654 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
APOC1P02654 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
APOC1P02654 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
APOC1P02654 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
APOC1P02654 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
APOC1P02654 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
APOC1P02654 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
APOC1P02654 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOC1P02654 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOC1P02654 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOC1P02654 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOC1P02654 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOC1P02654 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOC1P02654 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOC1P02654 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
APOC1P02654 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOC1P02654 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOC1P02654 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOC1P02654 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOC1P02654 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOC1P02654 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
APOC1P02654 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOC1P02654 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOC1P02654 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOC1P02654 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOC1P02654 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOC1P02654 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOC1P02654 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOC1P02654 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOC1P02654 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOC1P02654 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOC1P02654 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOC1P02654 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
APOC1P02654 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOC1P02654 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOC1P02654 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOC1P02654 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOC1P02654 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOC1P02654 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOC1P02654 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOC1P02654 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOC1P02654 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOC1P02654 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOC1P02654 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOC1P02654 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOC1P02654 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOC1P02654 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOC1P02654 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOC1P02654 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
APOC1P02654 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
APOC1P02654 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOC1P02654 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOC1P02654 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOC1P02654 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOC1P02654 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
APOC1P02654 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOC1P02654 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOC1P02654 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOC1P02654 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOC1P02654 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOC1P02654 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOC1P02654 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOC1P02654 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOC1P02654 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOC1P02654 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOC1P02654 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOC1P02654 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.6 ms