Protein–RNA interactions for Protein: P01350

GAST, Gastrin, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GASTP01350 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GASTP01350 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GASTP01350 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GASTP01350 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GASTP01350 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GASTP01350 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GASTP01350 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GASTP01350 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GASTP01350 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GASTP01350 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GASTP01350 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GASTP01350 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GASTP01350 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GASTP01350 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GASTP01350 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GASTP01350 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GASTP01350 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GASTP01350 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GASTP01350 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GASTP01350 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GASTP01350 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GASTP01350 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GASTP01350 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GASTP01350 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GASTP01350 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GASTP01350 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GASTP01350 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GASTP01350 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GASTP01350 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GASTP01350 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GASTP01350 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GASTP01350 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GASTP01350 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GASTP01350 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GASTP01350 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GASTP01350 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GASTP01350 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GASTP01350 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GASTP01350 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GASTP01350 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GASTP01350 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GASTP01350 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GASTP01350 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GASTP01350 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GASTP01350 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GASTP01350 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GASTP01350 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GASTP01350 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GASTP01350 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GASTP01350 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GASTP01350 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GASTP01350 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
GASTP01350 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GASTP01350 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GASTP01350 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GASTP01350 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GASTP01350 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GASTP01350 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GASTP01350 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GASTP01350 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GASTP01350 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GASTP01350 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GASTP01350 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GASTP01350 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GASTP01350 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GASTP01350 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GASTP01350 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GASTP01350 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GASTP01350 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GASTP01350 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GASTP01350 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GASTP01350 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GASTP01350 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GASTP01350 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GASTP01350 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GASTP01350 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GASTP01350 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GASTP01350 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GASTP01350 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GASTP01350 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GASTP01350 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GASTP01350 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GASTP01350 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GASTP01350 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GASTP01350 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GASTP01350 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GASTP01350 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GASTP01350 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GASTP01350 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GASTP01350 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GASTP01350 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GASTP01350 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GASTP01350 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GASTP01350 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GASTP01350 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GASTP01350 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GASTP01350 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GASTP01350 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GASTP01350 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GASTP01350 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms