Protein–RNA interactions for Protein: P00736

C1R, Complement C1r subcomponent, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1RP00736 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
C1RP00736 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
C1RP00736 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
C1RP00736 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
C1RP00736 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
C1RP00736 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
C1RP00736 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
C1RP00736 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
C1RP00736 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
C1RP00736 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
C1RP00736 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
C1RP00736 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
C1RP00736 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
C1RP00736 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
C1RP00736 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
C1RP00736 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
C1RP00736 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
C1RP00736 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
C1RP00736 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
C1RP00736 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
C1RP00736 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
C1RP00736 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
C1RP00736 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
C1RP00736 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
C1RP00736 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
C1RP00736 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
C1RP00736 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
C1RP00736 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
C1RP00736 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
C1RP00736 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
C1RP00736 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
C1RP00736 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
C1RP00736 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
C1RP00736 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
C1RP00736 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
C1RP00736 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
C1RP00736 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
C1RP00736 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
C1RP00736 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
C1RP00736 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
C1RP00736 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
C1RP00736 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
C1RP00736 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
C1RP00736 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
C1RP00736 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
C1RP00736 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
C1RP00736 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
C1RP00736 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
C1RP00736 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
C1RP00736 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
C1RP00736 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
C1RP00736 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
C1RP00736 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
C1RP00736 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
C1RP00736 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
C1RP00736 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
C1RP00736 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
C1RP00736 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
C1RP00736 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
C1RP00736 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
C1RP00736 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
C1RP00736 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
C1RP00736 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
C1RP00736 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
C1RP00736 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
C1RP00736 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
C1RP00736 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
C1RP00736 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
C1RP00736 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
C1RP00736 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
C1RP00736 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
C1RP00736 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
C1RP00736 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
C1RP00736 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
C1RP00736 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
C1RP00736 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
C1RP00736 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
C1RP00736 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
C1RP00736 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
C1RP00736 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
C1RP00736 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
C1RP00736 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
C1RP00736 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
C1RP00736 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
C1RP00736 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
C1RP00736 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
C1RP00736 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
C1RP00736 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
C1RP00736 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
C1RP00736 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
C1RP00736 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
C1RP00736 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
C1RP00736 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
C1RP00736 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
C1RP00736 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
C1RP00736 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
C1RP00736 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
C1RP00736 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
C1RP00736 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
C1RP00736 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms