Protein–RNA interactions for Protein: O75841

UPK1B, Uroplakin-1b, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK1BO75841 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UPK1BO75841 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UPK1BO75841 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UPK1BO75841 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UPK1BO75841 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UPK1BO75841 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UPK1BO75841 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UPK1BO75841 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UPK1BO75841 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UPK1BO75841 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UPK1BO75841 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
UPK1BO75841 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UPK1BO75841 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UPK1BO75841 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UPK1BO75841 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UPK1BO75841 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UPK1BO75841 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UPK1BO75841 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UPK1BO75841 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UPK1BO75841 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UPK1BO75841 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UPK1BO75841 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UPK1BO75841 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UPK1BO75841 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UPK1BO75841 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UPK1BO75841 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.23
UPK1BO75841 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.23
UPK1BO75841 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UPK1BO75841 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UPK1BO75841 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UPK1BO75841 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UPK1BO75841 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UPK1BO75841 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UPK1BO75841 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UPK1BO75841 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UPK1BO75841 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UPK1BO75841 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UPK1BO75841 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UPK1BO75841 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UPK1BO75841 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UPK1BO75841 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UPK1BO75841 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
UPK1BO75841 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UPK1BO75841 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UPK1BO75841 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UPK1BO75841 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UPK1BO75841 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
UPK1BO75841 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
UPK1BO75841 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UPK1BO75841 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UPK1BO75841 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UPK1BO75841 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UPK1BO75841 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UPK1BO75841 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UPK1BO75841 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UPK1BO75841 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UPK1BO75841 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UPK1BO75841 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UPK1BO75841 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UPK1BO75841 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UPK1BO75841 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UPK1BO75841 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
UPK1BO75841 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UPK1BO75841 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UPK1BO75841 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UPK1BO75841 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UPK1BO75841 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UPK1BO75841 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UPK1BO75841 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UPK1BO75841 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UPK1BO75841 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UPK1BO75841 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UPK1BO75841 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
UPK1BO75841 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UPK1BO75841 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UPK1BO75841 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UPK1BO75841 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
UPK1BO75841 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UPK1BO75841 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UPK1BO75841 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UPK1BO75841 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UPK1BO75841 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UPK1BO75841 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UPK1BO75841 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UPK1BO75841 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UPK1BO75841 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UPK1BO75841 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UPK1BO75841 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UPK1BO75841 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UPK1BO75841 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UPK1BO75841 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UPK1BO75841 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UPK1BO75841 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UPK1BO75841 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UPK1BO75841 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UPK1BO75841 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UPK1BO75841 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UPK1BO75841 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UPK1BO75841 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
UPK1BO75841 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms