Protein–RNA interactions for Protein: O75054

IGSF3, Immunoglobulin superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF3O75054 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC31.42■■■□□ 2.62
IGSF3O75054 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
IGSF3O75054 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
IGSF3O75054 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
IGSF3O75054 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
IGSF3O75054 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
IGSF3O75054 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
IGSF3O75054 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
IGSF3O75054 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
IGSF3O75054 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
IGSF3O75054 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
IGSF3O75054 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
IGSF3O75054 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
IGSF3O75054 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
IGSF3O75054 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
IGSF3O75054 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
IGSF3O75054 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
IGSF3O75054 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
IGSF3O75054 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
IGSF3O75054 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
IGSF3O75054 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
IGSF3O75054 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
IGSF3O75054 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
IGSF3O75054 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
IGSF3O75054 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC31.37■■■□□ 2.61
IGSF3O75054 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC31.37■■■□□ 2.61
IGSF3O75054 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
IGSF3O75054 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
IGSF3O75054 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
IGSF3O75054 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
IGSF3O75054 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC31.35■■■□□ 2.61
IGSF3O75054 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
IGSF3O75054 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC31.34■■■□□ 2.61
IGSF3O75054 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
IGSF3O75054 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
IGSF3O75054 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
IGSF3O75054 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
IGSF3O75054 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
IGSF3O75054 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
IGSF3O75054 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
IGSF3O75054 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
IGSF3O75054 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
IGSF3O75054 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
IGSF3O75054 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
IGSF3O75054 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
IGSF3O75054 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
IGSF3O75054 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
IGSF3O75054 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
IGSF3O75054 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
IGSF3O75054 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
IGSF3O75054 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC31.26■■■□□ 2.59
IGSF3O75054 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
IGSF3O75054 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
IGSF3O75054 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
IGSF3O75054 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
IGSF3O75054 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
IGSF3O75054 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
IGSF3O75054 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
IGSF3O75054 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
IGSF3O75054 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
IGSF3O75054 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
IGSF3O75054 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
IGSF3O75054 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
IGSF3O75054 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
IGSF3O75054 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
IGSF3O75054 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
IGSF3O75054 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
IGSF3O75054 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
IGSF3O75054 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
IGSF3O75054 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
IGSF3O75054 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
IGSF3O75054 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
IGSF3O75054 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
IGSF3O75054 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
IGSF3O75054 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
IGSF3O75054 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
IGSF3O75054 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
IGSF3O75054 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
IGSF3O75054 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
IGSF3O75054 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
IGSF3O75054 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
IGSF3O75054 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
IGSF3O75054 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
IGSF3O75054 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC31.14■■■□□ 2.57
IGSF3O75054 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
IGSF3O75054 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
IGSF3O75054 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
IGSF3O75054 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
IGSF3O75054 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
IGSF3O75054 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
IGSF3O75054 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
IGSF3O75054 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
IGSF3O75054 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
IGSF3O75054 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
IGSF3O75054 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
IGSF3O75054 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
IGSF3O75054 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
IGSF3O75054 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
IGSF3O75054 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
IGSF3O75054 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC31.08■■■□□ 2.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms