Protein–RNA interactions for Protein: O43918

AIRE, Autoimmune regulator, humanhuman

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AIREO43918 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AIREO43918 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AIREO43918 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AIREO43918 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AIREO43918 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
AIREO43918 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AIREO43918 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AIREO43918 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AIREO43918 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AIREO43918 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AIREO43918 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AIREO43918 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AIREO43918 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AIREO43918 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AIREO43918 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AIREO43918 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AIREO43918 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AIREO43918 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AIREO43918 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AIREO43918 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AIREO43918 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AIREO43918 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AIREO43918 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AIREO43918 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AIREO43918 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AIREO43918 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AIREO43918 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AIREO43918 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AIREO43918 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AIREO43918 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AIREO43918 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AIREO43918 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AIREO43918 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AIREO43918 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
AIREO43918 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AIREO43918 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
AIREO43918 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AIREO43918 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AIREO43918 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AIREO43918 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AIREO43918 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AIREO43918 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AIREO43918 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AIREO43918 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AIREO43918 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AIREO43918 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AIREO43918 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AIREO43918 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AIREO43918 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AIREO43918 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AIREO43918 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AIREO43918 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AIREO43918 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AIREO43918 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AIREO43918 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AIREO43918 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AIREO43918 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
AIREO43918 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AIREO43918 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AIREO43918 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AIREO43918 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AIREO43918 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
AIREO43918 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
AIREO43918 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AIREO43918 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AIREO43918 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AIREO43918 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AIREO43918 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
AIREO43918 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
AIREO43918 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AIREO43918 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AIREO43918 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AIREO43918 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AIREO43918 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AIREO43918 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AIREO43918 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AIREO43918 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
AIREO43918 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AIREO43918 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AIREO43918 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AIREO43918 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AIREO43918 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
AIREO43918 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AIREO43918 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AIREO43918 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AIREO43918 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AIREO43918 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AIREO43918 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AIREO43918 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AIREO43918 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AIREO43918 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AIREO43918 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AIREO43918 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AIREO43918 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AIREO43918 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AIREO43918 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
AIREO43918 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
AIREO43918 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AIREO43918 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AIREO43918 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms