Protein–RNA interactions for Protein: O43525

KCNQ3, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 3, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ3O43525 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
KCNQ3O43525 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
KCNQ3O43525 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
KCNQ3O43525 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
KCNQ3O43525 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
KCNQ3O43525 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
KCNQ3O43525 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
KCNQ3O43525 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
KCNQ3O43525 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
KCNQ3O43525 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
KCNQ3O43525 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
KCNQ3O43525 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
KCNQ3O43525 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
KCNQ3O43525 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
KCNQ3O43525 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
KCNQ3O43525 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
KCNQ3O43525 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC33.82■■■■□ 3
KCNQ3O43525 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
KCNQ3O43525 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
KCNQ3O43525 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
KCNQ3O43525 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
KCNQ3O43525 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
KCNQ3O43525 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
KCNQ3O43525 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
KCNQ3O43525 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
KCNQ3O43525 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
KCNQ3O43525 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
KCNQ3O43525 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC33.77■■■■□ 3
KCNQ3O43525 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
KCNQ3O43525 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
KCNQ3O43525 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
KCNQ3O43525 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
KCNQ3O43525 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
KCNQ3O43525 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
KCNQ3O43525 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
KCNQ3O43525 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
KCNQ3O43525 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
KCNQ3O43525 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
KCNQ3O43525 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
KCNQ3O43525 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
KCNQ3O43525 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
KCNQ3O43525 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
KCNQ3O43525 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
KCNQ3O43525 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
KCNQ3O43525 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
KCNQ3O43525 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
KCNQ3O43525 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
KCNQ3O43525 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
KCNQ3O43525 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
KCNQ3O43525 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
KCNQ3O43525 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
KCNQ3O43525 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
KCNQ3O43525 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
KCNQ3O43525 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
KCNQ3O43525 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
KCNQ3O43525 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
KCNQ3O43525 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
KCNQ3O43525 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
KCNQ3O43525 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
KCNQ3O43525 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
KCNQ3O43525 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.97
KCNQ3O43525 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
KCNQ3O43525 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
KCNQ3O43525 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
KCNQ3O43525 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
KCNQ3O43525 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
KCNQ3O43525 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
KCNQ3O43525 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
KCNQ3O43525 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
KCNQ3O43525 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
KCNQ3O43525 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
KCNQ3O43525 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
KCNQ3O43525 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
KCNQ3O43525 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
KCNQ3O43525 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
KCNQ3O43525 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC33.51■■■□□ 2.96
KCNQ3O43525 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
KCNQ3O43525 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
KCNQ3O43525 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
KCNQ3O43525 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
KCNQ3O43525 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
KCNQ3O43525 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
KCNQ3O43525 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
KCNQ3O43525 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
KCNQ3O43525 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
KCNQ3O43525 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
KCNQ3O43525 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
KCNQ3O43525 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
KCNQ3O43525 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
KCNQ3O43525 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
KCNQ3O43525 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
KCNQ3O43525 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
KCNQ3O43525 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
KCNQ3O43525 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
KCNQ3O43525 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
KCNQ3O43525 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
KCNQ3O43525 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
KCNQ3O43525 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
KCNQ3O43525 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
KCNQ3O43525 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms