Protein–RNA interactions for Protein: O15524

SOCS1, Suppressor of cytokine signaling 1, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS1O15524 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SOCS1O15524 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SOCS1O15524 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SOCS1O15524 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SOCS1O15524 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SOCS1O15524 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SOCS1O15524 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SOCS1O15524 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SOCS1O15524 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SOCS1O15524 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SOCS1O15524 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SOCS1O15524 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SOCS1O15524 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SOCS1O15524 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SOCS1O15524 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SOCS1O15524 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SOCS1O15524 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SOCS1O15524 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SOCS1O15524 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SOCS1O15524 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SOCS1O15524 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SOCS1O15524 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SOCS1O15524 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SOCS1O15524 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SOCS1O15524 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SOCS1O15524 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SOCS1O15524 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SOCS1O15524 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SOCS1O15524 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SOCS1O15524 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SOCS1O15524 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SOCS1O15524 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SOCS1O15524 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SOCS1O15524 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SOCS1O15524 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SOCS1O15524 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SOCS1O15524 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SOCS1O15524 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SOCS1O15524 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SOCS1O15524 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SOCS1O15524 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SOCS1O15524 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SOCS1O15524 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SOCS1O15524 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SOCS1O15524 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SOCS1O15524 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SOCS1O15524 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SOCS1O15524 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SOCS1O15524 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SOCS1O15524 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SOCS1O15524 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SOCS1O15524 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SOCS1O15524 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SOCS1O15524 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SOCS1O15524 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SOCS1O15524 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SOCS1O15524 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SOCS1O15524 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SOCS1O15524 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SOCS1O15524 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SOCS1O15524 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SOCS1O15524 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SOCS1O15524 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SOCS1O15524 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SOCS1O15524 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SOCS1O15524 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SOCS1O15524 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SOCS1O15524 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SOCS1O15524 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SOCS1O15524 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SOCS1O15524 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SOCS1O15524 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SOCS1O15524 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SOCS1O15524 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SOCS1O15524 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SOCS1O15524 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SOCS1O15524 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SOCS1O15524 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SOCS1O15524 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SOCS1O15524 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SOCS1O15524 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SOCS1O15524 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SOCS1O15524 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SOCS1O15524 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SOCS1O15524 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SOCS1O15524 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SOCS1O15524 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SOCS1O15524 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SOCS1O15524 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SOCS1O15524 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SOCS1O15524 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SOCS1O15524 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SOCS1O15524 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SOCS1O15524 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SOCS1O15524 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SOCS1O15524 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SOCS1O15524 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SOCS1O15524 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SOCS1O15524 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SOCS1O15524 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms