Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLGNO14967 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLGNO14967 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLGNO14967 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLGNO14967 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLGNO14967 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLGNO14967 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLGNO14967 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLGNO14967 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLGNO14967 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLGNO14967 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLGNO14967 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLGNO14967 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLGNO14967 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CLGNO14967 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CLGNO14967 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLGNO14967 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLGNO14967 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLGNO14967 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLGNO14967 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLGNO14967 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLGNO14967 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLGNO14967 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLGNO14967 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLGNO14967 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLGNO14967 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLGNO14967 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLGNO14967 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLGNO14967 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLGNO14967 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLGNO14967 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLGNO14967 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLGNO14967 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLGNO14967 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLGNO14967 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLGNO14967 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLGNO14967 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLGNO14967 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLGNO14967 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLGNO14967 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLGNO14967 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLGNO14967 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLGNO14967 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLGNO14967 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLGNO14967 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLGNO14967 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLGNO14967 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLGNO14967 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLGNO14967 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLGNO14967 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLGNO14967 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLGNO14967 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLGNO14967 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLGNO14967 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLGNO14967 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLGNO14967 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLGNO14967 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLGNO14967 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLGNO14967 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLGNO14967 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CLGNO14967 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLGNO14967 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLGNO14967 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLGNO14967 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLGNO14967 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CLGNO14967 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLGNO14967 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLGNO14967 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLGNO14967 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLGNO14967 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLGNO14967 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLGNO14967 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLGNO14967 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLGNO14967 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CLGNO14967 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLGNO14967 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLGNO14967 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLGNO14967 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLGNO14967 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLGNO14967 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLGNO14967 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLGNO14967 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLGNO14967 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLGNO14967 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLGNO14967 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CLGNO14967 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CLGNO14967 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLGNO14967 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLGNO14967 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLGNO14967 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLGNO14967 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLGNO14967 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLGNO14967 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLGNO14967 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CLGNO14967 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLGNO14967 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLGNO14967 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLGNO14967 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLGNO14967 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLGNO14967 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms