Protein–RNA interactions for Protein: O14656

TOR1A, Torsin-1A, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOR1AO14656 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TOR1AO14656 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TOR1AO14656 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TOR1AO14656 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TOR1AO14656 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TOR1AO14656 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TOR1AO14656 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TOR1AO14656 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TOR1AO14656 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TOR1AO14656 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TOR1AO14656 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TOR1AO14656 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TOR1AO14656 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TOR1AO14656 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TOR1AO14656 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TOR1AO14656 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TOR1AO14656 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TOR1AO14656 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TOR1AO14656 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TOR1AO14656 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TOR1AO14656 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TOR1AO14656 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TOR1AO14656 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TOR1AO14656 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TOR1AO14656 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TOR1AO14656 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TOR1AO14656 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TOR1AO14656 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TOR1AO14656 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TOR1AO14656 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TOR1AO14656 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TOR1AO14656 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TOR1AO14656 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TOR1AO14656 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TOR1AO14656 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TOR1AO14656 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TOR1AO14656 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TOR1AO14656 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TOR1AO14656 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TOR1AO14656 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TOR1AO14656 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TOR1AO14656 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TOR1AO14656 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TOR1AO14656 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TOR1AO14656 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TOR1AO14656 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TOR1AO14656 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TOR1AO14656 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TOR1AO14656 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TOR1AO14656 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TOR1AO14656 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TOR1AO14656 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TOR1AO14656 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TOR1AO14656 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TOR1AO14656 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TOR1AO14656 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TOR1AO14656 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TOR1AO14656 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TOR1AO14656 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TOR1AO14656 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TOR1AO14656 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TOR1AO14656 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TOR1AO14656 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TOR1AO14656 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TOR1AO14656 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TOR1AO14656 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TOR1AO14656 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TOR1AO14656 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TOR1AO14656 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TOR1AO14656 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TOR1AO14656 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TOR1AO14656 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TOR1AO14656 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TOR1AO14656 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TOR1AO14656 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TOR1AO14656 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TOR1AO14656 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TOR1AO14656 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TOR1AO14656 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TOR1AO14656 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TOR1AO14656 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TOR1AO14656 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TOR1AO14656 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TOR1AO14656 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TOR1AO14656 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TOR1AO14656 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TOR1AO14656 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TOR1AO14656 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TOR1AO14656 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TOR1AO14656 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TOR1AO14656 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TOR1AO14656 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TOR1AO14656 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TOR1AO14656 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TOR1AO14656 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TOR1AO14656 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TOR1AO14656 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TOR1AO14656 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TOR1AO14656 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TOR1AO14656 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms