Protein–RNA interactions for Protein: O00253

AGRP, Agouti-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGRPO00253 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
AGRPO00253 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
AGRPO00253 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
AGRPO00253 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
AGRPO00253 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
AGRPO00253 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
AGRPO00253 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
AGRPO00253 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
AGRPO00253 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
AGRPO00253 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
AGRPO00253 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
AGRPO00253 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
AGRPO00253 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
AGRPO00253 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
AGRPO00253 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
AGRPO00253 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
AGRPO00253 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
AGRPO00253 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
AGRPO00253 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
AGRPO00253 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
AGRPO00253 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
AGRPO00253 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
AGRPO00253 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
AGRPO00253 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
AGRPO00253 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
AGRPO00253 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
AGRPO00253 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
AGRPO00253 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
AGRPO00253 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
AGRPO00253 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
AGRPO00253 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
AGRPO00253 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
AGRPO00253 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
AGRPO00253 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
AGRPO00253 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
AGRPO00253 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
AGRPO00253 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
AGRPO00253 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
AGRPO00253 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
AGRPO00253 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
AGRPO00253 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
AGRPO00253 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
AGRPO00253 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
AGRPO00253 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
AGRPO00253 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AGRPO00253 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AGRPO00253 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AGRPO00253 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AGRPO00253 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
AGRPO00253 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AGRPO00253 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
AGRPO00253 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
AGRPO00253 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
AGRPO00253 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
AGRPO00253 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
AGRPO00253 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
AGRPO00253 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AGRPO00253 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
AGRPO00253 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
AGRPO00253 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
AGRPO00253 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
AGRPO00253 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
AGRPO00253 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
AGRPO00253 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
AGRPO00253 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
AGRPO00253 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
AGRPO00253 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
AGRPO00253 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
AGRPO00253 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
AGRPO00253 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
AGRPO00253 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
AGRPO00253 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
AGRPO00253 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
AGRPO00253 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
AGRPO00253 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
AGRPO00253 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AGRPO00253 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AGRPO00253 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AGRPO00253 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
AGRPO00253 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AGRPO00253 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AGRPO00253 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AGRPO00253 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AGRPO00253 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
AGRPO00253 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
AGRPO00253 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AGRPO00253 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AGRPO00253 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
AGRPO00253 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
AGRPO00253 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
AGRPO00253 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
AGRPO00253 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
AGRPO00253 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
AGRPO00253 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
AGRPO00253 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
AGRPO00253 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
AGRPO00253 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
AGRPO00253 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
AGRPO00253 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
AGRPO00253 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms