Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.9 ms