Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

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Length 477 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
ERVV-1B6SEH8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
ERVV-1B6SEH8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
ERVV-1B6SEH8 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
ERVV-1B6SEH8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
ERVV-1B6SEH8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
ERVV-1B6SEH8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
ERVV-1B6SEH8 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
ERVV-1B6SEH8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
ERVV-1B6SEH8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
ERVV-1B6SEH8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
ERVV-1B6SEH8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
ERVV-1B6SEH8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
ERVV-1B6SEH8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
ERVV-1B6SEH8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
ERVV-1B6SEH8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
ERVV-1B6SEH8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
ERVV-1B6SEH8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
ERVV-1B6SEH8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
ERVV-1B6SEH8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
ERVV-1B6SEH8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
ERVV-1B6SEH8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
ERVV-1B6SEH8 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
ERVV-1B6SEH8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
ERVV-1B6SEH8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC33.01■■■□□ 2.88
ERVV-1B6SEH8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
ERVV-1B6SEH8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
ERVV-1B6SEH8 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
ERVV-1B6SEH8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
ERVV-1B6SEH8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
ERVV-1B6SEH8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
ERVV-1B6SEH8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
ERVV-1B6SEH8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC32.99■■■□□ 2.87
ERVV-1B6SEH8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
ERVV-1B6SEH8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
ERVV-1B6SEH8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
ERVV-1B6SEH8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
ERVV-1B6SEH8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
ERVV-1B6SEH8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
ERVV-1B6SEH8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
ERVV-1B6SEH8 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
ERVV-1B6SEH8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
ERVV-1B6SEH8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC32.96■■■□□ 2.87
ERVV-1B6SEH8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
ERVV-1B6SEH8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
ERVV-1B6SEH8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
ERVV-1B6SEH8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
ERVV-1B6SEH8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC32.94■■■□□ 2.86
ERVV-1B6SEH8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
ERVV-1B6SEH8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
ERVV-1B6SEH8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
ERVV-1B6SEH8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
ERVV-1B6SEH8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
ERVV-1B6SEH8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
ERVV-1B6SEH8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
ERVV-1B6SEH8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
ERVV-1B6SEH8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
ERVV-1B6SEH8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
ERVV-1B6SEH8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
ERVV-1B6SEH8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC32.86■■■□□ 2.85
ERVV-1B6SEH8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
ERVV-1B6SEH8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
ERVV-1B6SEH8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
ERVV-1B6SEH8 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
ERVV-1B6SEH8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
ERVV-1B6SEH8 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
ERVV-1B6SEH8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
ERVV-1B6SEH8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
ERVV-1B6SEH8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
ERVV-1B6SEH8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
ERVV-1B6SEH8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
ERVV-1B6SEH8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
ERVV-1B6SEH8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
ERVV-1B6SEH8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
ERVV-1B6SEH8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
ERVV-1B6SEH8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
ERVV-1B6SEH8 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
ERVV-1B6SEH8 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
ERVV-1B6SEH8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
ERVV-1B6SEH8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
ERVV-1B6SEH8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
ERVV-1B6SEH8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
ERVV-1B6SEH8 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
ERVV-1B6SEH8 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
ERVV-1B6SEH8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
ERVV-1B6SEH8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
ERVV-1B6SEH8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.83
ERVV-1B6SEH8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
ERVV-1B6SEH8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
ERVV-1B6SEH8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
ERVV-1B6SEH8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
ERVV-1B6SEH8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
ERVV-1B6SEH8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
ERVV-1B6SEH8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
ERVV-1B6SEH8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
ERVV-1B6SEH8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
ERVV-1B6SEH8 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
ERVV-1B6SEH8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
ERVV-1B6SEH8 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC32.73■■■□□ 2.83
ERVV-1B6SEH8 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC32.73■■■□□ 2.83
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