Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HMGB1P1B2RPK0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HMGB1P1B2RPK0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HMGB1P1B2RPK0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HMGB1P1B2RPK0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HMGB1P1B2RPK0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HMGB1P1B2RPK0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HMGB1P1B2RPK0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HMGB1P1B2RPK0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HMGB1P1B2RPK0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HMGB1P1B2RPK0 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HMGB1P1B2RPK0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HMGB1P1B2RPK0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HMGB1P1B2RPK0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HMGB1P1B2RPK0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HMGB1P1B2RPK0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HMGB1P1B2RPK0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HMGB1P1B2RPK0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HMGB1P1B2RPK0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
HMGB1P1B2RPK0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
HMGB1P1B2RPK0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
HMGB1P1B2RPK0 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HMGB1P1B2RPK0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HMGB1P1B2RPK0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HMGB1P1B2RPK0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
HMGB1P1B2RPK0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HMGB1P1B2RPK0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HMGB1P1B2RPK0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HMGB1P1B2RPK0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HMGB1P1B2RPK0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HMGB1P1B2RPK0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HMGB1P1B2RPK0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HMGB1P1B2RPK0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HMGB1P1B2RPK0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HMGB1P1B2RPK0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HMGB1P1B2RPK0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HMGB1P1B2RPK0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HMGB1P1B2RPK0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HMGB1P1B2RPK0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HMGB1P1B2RPK0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HMGB1P1B2RPK0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HMGB1P1B2RPK0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HMGB1P1B2RPK0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HMGB1P1B2RPK0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HMGB1P1B2RPK0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HMGB1P1B2RPK0 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HMGB1P1B2RPK0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HMGB1P1B2RPK0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HMGB1P1B2RPK0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HMGB1P1B2RPK0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HMGB1P1B2RPK0 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HMGB1P1B2RPK0 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HMGB1P1B2RPK0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HMGB1P1B2RPK0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HMGB1P1B2RPK0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HMGB1P1B2RPK0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HMGB1P1B2RPK0 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HMGB1P1B2RPK0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HMGB1P1B2RPK0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HMGB1P1B2RPK0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HMGB1P1B2RPK0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HMGB1P1B2RPK0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HMGB1P1B2RPK0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HMGB1P1B2RPK0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HMGB1P1B2RPK0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
HMGB1P1B2RPK0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HMGB1P1B2RPK0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HMGB1P1B2RPK0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HMGB1P1B2RPK0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HMGB1P1B2RPK0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HMGB1P1B2RPK0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HMGB1P1B2RPK0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HMGB1P1B2RPK0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HMGB1P1B2RPK0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HMGB1P1B2RPK0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HMGB1P1B2RPK0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HMGB1P1B2RPK0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HMGB1P1B2RPK0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HMGB1P1B2RPK0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HMGB1P1B2RPK0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HMGB1P1B2RPK0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HMGB1P1B2RPK0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HMGB1P1B2RPK0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HMGB1P1B2RPK0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HMGB1P1B2RPK0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HMGB1P1B2RPK0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HMGB1P1B2RPK0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HMGB1P1B2RPK0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
HMGB1P1B2RPK0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HMGB1P1B2RPK0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HMGB1P1B2RPK0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
HMGB1P1B2RPK0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HMGB1P1B2RPK0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HMGB1P1B2RPK0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HMGB1P1B2RPK0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HMGB1P1B2RPK0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HMGB1P1B2RPK0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HMGB1P1B2RPK0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
HMGB1P1B2RPK0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HMGB1P1B2RPK0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms