Protein–RNA interactions for Protein: A8MW95

BECN2, Beclin-2, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN2A8MW95 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
BECN2A8MW95 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
BECN2A8MW95 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
BECN2A8MW95 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
BECN2A8MW95 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
BECN2A8MW95 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
BECN2A8MW95 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
BECN2A8MW95 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
BECN2A8MW95 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
BECN2A8MW95 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
BECN2A8MW95 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
BECN2A8MW95 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
BECN2A8MW95 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
BECN2A8MW95 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
BECN2A8MW95 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
BECN2A8MW95 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
BECN2A8MW95 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
BECN2A8MW95 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
BECN2A8MW95 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
BECN2A8MW95 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
BECN2A8MW95 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
BECN2A8MW95 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
BECN2A8MW95 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
BECN2A8MW95 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
BECN2A8MW95 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
BECN2A8MW95 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
BECN2A8MW95 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
BECN2A8MW95 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
BECN2A8MW95 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
BECN2A8MW95 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
BECN2A8MW95 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
BECN2A8MW95 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
BECN2A8MW95 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
BECN2A8MW95 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
BECN2A8MW95 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
BECN2A8MW95 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
BECN2A8MW95 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
BECN2A8MW95 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
BECN2A8MW95 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
BECN2A8MW95 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
BECN2A8MW95 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
BECN2A8MW95 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
BECN2A8MW95 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
BECN2A8MW95 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
BECN2A8MW95 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
BECN2A8MW95 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
BECN2A8MW95 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
BECN2A8MW95 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
BECN2A8MW95 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
BECN2A8MW95 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
BECN2A8MW95 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
BECN2A8MW95 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
BECN2A8MW95 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
BECN2A8MW95 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
BECN2A8MW95 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
BECN2A8MW95 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
BECN2A8MW95 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
BECN2A8MW95 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
BECN2A8MW95 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
BECN2A8MW95 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
BECN2A8MW95 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.83■■■□□ 2.2
BECN2A8MW95 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
BECN2A8MW95 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
BECN2A8MW95 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
BECN2A8MW95 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
BECN2A8MW95 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
BECN2A8MW95 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
BECN2A8MW95 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
BECN2A8MW95 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
BECN2A8MW95 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
BECN2A8MW95 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
BECN2A8MW95 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
BECN2A8MW95 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
BECN2A8MW95 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
BECN2A8MW95 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
BECN2A8MW95 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
BECN2A8MW95 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
BECN2A8MW95 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
BECN2A8MW95 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
BECN2A8MW95 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
BECN2A8MW95 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
BECN2A8MW95 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
BECN2A8MW95 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
BECN2A8MW95 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
BECN2A8MW95 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
BECN2A8MW95 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
BECN2A8MW95 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
BECN2A8MW95 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
BECN2A8MW95 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
BECN2A8MW95 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
BECN2A8MW95 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
BECN2A8MW95 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
BECN2A8MW95 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
BECN2A8MW95 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
BECN2A8MW95 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
BECN2A8MW95 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
BECN2A8MW95 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
BECN2A8MW95 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
BECN2A8MW95 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
BECN2A8MW95 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.6 ms