Protein–RNA interactions for Protein: A6NIU2

LINC01549, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01549, humanhuman

Predictions only

Length 74 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01549A6NIU2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC01549A6NIU2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC01549A6NIU2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC01549A6NIU2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC01549A6NIU2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC01549A6NIU2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC01549A6NIU2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC01549A6NIU2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC01549A6NIU2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LINC01549A6NIU2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LINC01549A6NIU2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LINC01549A6NIU2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LINC01549A6NIU2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC01549A6NIU2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC01549A6NIU2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LINC01549A6NIU2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LINC01549A6NIU2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LINC01549A6NIU2 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LINC01549A6NIU2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LINC01549A6NIU2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LINC01549A6NIU2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC01549A6NIU2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC01549A6NIU2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC01549A6NIU2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC01549A6NIU2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC01549A6NIU2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC01549A6NIU2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC01549A6NIU2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC01549A6NIU2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC01549A6NIU2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC01549A6NIU2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC01549A6NIU2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC01549A6NIU2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC01549A6NIU2 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC01549A6NIU2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC01549A6NIU2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC01549A6NIU2 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC01549A6NIU2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC01549A6NIU2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC01549A6NIU2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC01549A6NIU2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC01549A6NIU2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC01549A6NIU2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC01549A6NIU2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC01549A6NIU2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LINC01549A6NIU2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC01549A6NIU2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC01549A6NIU2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC01549A6NIU2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC01549A6NIU2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC01549A6NIU2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC01549A6NIU2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC01549A6NIU2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC01549A6NIU2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC01549A6NIU2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC01549A6NIU2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC01549A6NIU2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC01549A6NIU2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC01549A6NIU2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC01549A6NIU2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC01549A6NIU2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC01549A6NIU2 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC01549A6NIU2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC01549A6NIU2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC01549A6NIU2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC01549A6NIU2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC01549A6NIU2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC01549A6NIU2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC01549A6NIU2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC01549A6NIU2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC01549A6NIU2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC01549A6NIU2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC01549A6NIU2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC01549A6NIU2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC01549A6NIU2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC01549A6NIU2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC01549A6NIU2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC01549A6NIU2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC01549A6NIU2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC01549A6NIU2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC01549A6NIU2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC01549A6NIU2 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC01549A6NIU2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC01549A6NIU2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC01549A6NIU2 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC01549A6NIU2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC01549A6NIU2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC01549A6NIU2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC01549A6NIU2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC01549A6NIU2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC01549A6NIU2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC01549A6NIU2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC01549A6NIU2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC01549A6NIU2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC01549A6NIU2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC01549A6NIU2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC01549A6NIU2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC01549A6NIU2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC01549A6NIU2 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC01549A6NIU2 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms