Protein–RNA interactions for Protein: A2RU48

SMCO3, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO3A2RU48 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMCO3A2RU48 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMCO3A2RU48 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMCO3A2RU48 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMCO3A2RU48 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SMCO3A2RU48 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMCO3A2RU48 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMCO3A2RU48 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMCO3A2RU48 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMCO3A2RU48 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMCO3A2RU48 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMCO3A2RU48 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMCO3A2RU48 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMCO3A2RU48 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMCO3A2RU48 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMCO3A2RU48 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMCO3A2RU48 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SMCO3A2RU48 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SMCO3A2RU48 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SMCO3A2RU48 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SMCO3A2RU48 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SMCO3A2RU48 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SMCO3A2RU48 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SMCO3A2RU48 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SMCO3A2RU48 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SMCO3A2RU48 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SMCO3A2RU48 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMCO3A2RU48 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMCO3A2RU48 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMCO3A2RU48 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMCO3A2RU48 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMCO3A2RU48 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SMCO3A2RU48 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SMCO3A2RU48 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SMCO3A2RU48 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SMCO3A2RU48 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SMCO3A2RU48 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMCO3A2RU48 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMCO3A2RU48 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMCO3A2RU48 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMCO3A2RU48 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMCO3A2RU48 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMCO3A2RU48 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMCO3A2RU48 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
SMCO3A2RU48 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMCO3A2RU48 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMCO3A2RU48 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMCO3A2RU48 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMCO3A2RU48 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMCO3A2RU48 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMCO3A2RU48 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMCO3A2RU48 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMCO3A2RU48 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMCO3A2RU48 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
SMCO3A2RU48 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMCO3A2RU48 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMCO3A2RU48 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMCO3A2RU48 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMCO3A2RU48 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMCO3A2RU48 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMCO3A2RU48 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMCO3A2RU48 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMCO3A2RU48 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMCO3A2RU48 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMCO3A2RU48 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMCO3A2RU48 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMCO3A2RU48 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMCO3A2RU48 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMCO3A2RU48 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMCO3A2RU48 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMCO3A2RU48 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SMCO3A2RU48 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SMCO3A2RU48 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SMCO3A2RU48 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMCO3A2RU48 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMCO3A2RU48 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SMCO3A2RU48 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMCO3A2RU48 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMCO3A2RU48 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMCO3A2RU48 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMCO3A2RU48 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMCO3A2RU48 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMCO3A2RU48 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMCO3A2RU48 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMCO3A2RU48 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMCO3A2RU48 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMCO3A2RU48 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMCO3A2RU48 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMCO3A2RU48 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMCO3A2RU48 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMCO3A2RU48 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMCO3A2RU48 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMCO3A2RU48 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMCO3A2RU48 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMCO3A2RU48 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMCO3A2RU48 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMCO3A2RU48 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMCO3A2RU48 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMCO3A2RU48 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMCO3A2RU48 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms