Protein–RNA interactions for Protein: A2RU48

SMCO3, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO3A2RU48 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SMCO3A2RU48 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMCO3A2RU48 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMCO3A2RU48 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SMCO3A2RU48 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMCO3A2RU48 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMCO3A2RU48 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMCO3A2RU48 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMCO3A2RU48 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SMCO3A2RU48 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMCO3A2RU48 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMCO3A2RU48 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMCO3A2RU48 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMCO3A2RU48 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMCO3A2RU48 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMCO3A2RU48 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMCO3A2RU48 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMCO3A2RU48 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMCO3A2RU48 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMCO3A2RU48 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMCO3A2RU48 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMCO3A2RU48 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SMCO3A2RU48 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMCO3A2RU48 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SMCO3A2RU48 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMCO3A2RU48 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMCO3A2RU48 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMCO3A2RU48 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMCO3A2RU48 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMCO3A2RU48 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SMCO3A2RU48 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMCO3A2RU48 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMCO3A2RU48 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMCO3A2RU48 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMCO3A2RU48 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMCO3A2RU48 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMCO3A2RU48 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMCO3A2RU48 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMCO3A2RU48 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMCO3A2RU48 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMCO3A2RU48 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMCO3A2RU48 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMCO3A2RU48 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMCO3A2RU48 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SMCO3A2RU48 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMCO3A2RU48 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMCO3A2RU48 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMCO3A2RU48 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMCO3A2RU48 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMCO3A2RU48 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMCO3A2RU48 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMCO3A2RU48 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMCO3A2RU48 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMCO3A2RU48 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMCO3A2RU48 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMCO3A2RU48 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SMCO3A2RU48 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMCO3A2RU48 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMCO3A2RU48 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMCO3A2RU48 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMCO3A2RU48 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMCO3A2RU48 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMCO3A2RU48 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMCO3A2RU48 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMCO3A2RU48 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMCO3A2RU48 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SMCO3A2RU48 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMCO3A2RU48 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMCO3A2RU48 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMCO3A2RU48 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMCO3A2RU48 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMCO3A2RU48 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMCO3A2RU48 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMCO3A2RU48 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMCO3A2RU48 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMCO3A2RU48 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMCO3A2RU48 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMCO3A2RU48 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMCO3A2RU48 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMCO3A2RU48 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMCO3A2RU48 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMCO3A2RU48 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMCO3A2RU48 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMCO3A2RU48 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMCO3A2RU48 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMCO3A2RU48 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMCO3A2RU48 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMCO3A2RU48 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMCO3A2RU48 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMCO3A2RU48 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMCO3A2RU48 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMCO3A2RU48 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMCO3A2RU48 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMCO3A2RU48 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMCO3A2RU48 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMCO3A2RU48 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMCO3A2RU48 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMCO3A2RU48 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMCO3A2RU48 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMCO3A2RU48 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms