Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A0MS04

TRBV6-7, T-cell receptor beta variable 6-7 (non-functional) (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV6-7A0A0A0MS04 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRBV6-7A0A0A0MS04 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRBV6-7A0A0A0MS04 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRBV6-7A0A0A0MS04 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRBV6-7A0A0A0MS04 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRBV6-7A0A0A0MS04 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRBV6-7A0A0A0MS04 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRBV6-7A0A0A0MS04 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRBV6-7A0A0A0MS04 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRBV6-7A0A0A0MS04 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRBV6-7A0A0A0MS04 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRBV6-7A0A0A0MS04 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRBV6-7A0A0A0MS04 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRBV6-7A0A0A0MS04 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRBV6-7A0A0A0MS04 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRBV6-7A0A0A0MS04 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRBV6-7A0A0A0MS04 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRBV6-7A0A0A0MS04 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRBV6-7A0A0A0MS04 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRBV6-7A0A0A0MS04 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TRBV6-7A0A0A0MS04 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRBV6-7A0A0A0MS04 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRBV6-7A0A0A0MS04 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRBV6-7A0A0A0MS04 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRBV6-7A0A0A0MS04 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRBV6-7A0A0A0MS04 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRBV6-7A0A0A0MS04 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRBV6-7A0A0A0MS04 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRBV6-7A0A0A0MS04 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRBV6-7A0A0A0MS04 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRBV6-7A0A0A0MS04 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRBV6-7A0A0A0MS04 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRBV6-7A0A0A0MS04 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRBV6-7A0A0A0MS04 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRBV6-7A0A0A0MS04 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRBV6-7A0A0A0MS04 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRBV6-7A0A0A0MS04 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRBV6-7A0A0A0MS04 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TRBV6-7A0A0A0MS04 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRBV6-7A0A0A0MS04 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRBV6-7A0A0A0MS04 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRBV6-7A0A0A0MS04 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRBV6-7A0A0A0MS04 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRBV6-7A0A0A0MS04 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRBV6-7A0A0A0MS04 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRBV6-7A0A0A0MS04 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRBV6-7A0A0A0MS04 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRBV6-7A0A0A0MS04 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRBV6-7A0A0A0MS04 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRBV6-7A0A0A0MS04 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRBV6-7A0A0A0MS04 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRBV6-7A0A0A0MS04 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRBV6-7A0A0A0MS04 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRBV6-7A0A0A0MS04 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRBV6-7A0A0A0MS04 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRBV6-7A0A0A0MS04 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRBV6-7A0A0A0MS04 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRBV6-7A0A0A0MS04 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRBV6-7A0A0A0MS04 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRBV6-7A0A0A0MS04 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRBV6-7A0A0A0MS04 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TRBV6-7A0A0A0MS04 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRBV6-7A0A0A0MS04 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRBV6-7A0A0A0MS04 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRBV6-7A0A0A0MS04 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRBV6-7A0A0A0MS04 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRBV6-7A0A0A0MS04 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRBV6-7A0A0A0MS04 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRBV6-7A0A0A0MS04 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRBV6-7A0A0A0MS04 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRBV6-7A0A0A0MS04 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRBV6-7A0A0A0MS04 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRBV6-7A0A0A0MS04 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRBV6-7A0A0A0MS04 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRBV6-7A0A0A0MS04 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRBV6-7A0A0A0MS04 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRBV6-7A0A0A0MS04 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRBV6-7A0A0A0MS04 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRBV6-7A0A0A0MS04 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TRBV6-7A0A0A0MS04 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRBV6-7A0A0A0MS04 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRBV6-7A0A0A0MS04 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TRBV6-7A0A0A0MS04 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRBV6-7A0A0A0MS04 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRBV6-7A0A0A0MS04 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRBV6-7A0A0A0MS04 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRBV6-7A0A0A0MS04 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRBV6-7A0A0A0MS04 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRBV6-7A0A0A0MS04 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRBV6-7A0A0A0MS04 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRBV6-7A0A0A0MS04 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRBV6-7A0A0A0MS04 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRBV6-7A0A0A0MS04 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRBV6-7A0A0A0MS04 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRBV6-7A0A0A0MS04 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRBV6-7A0A0A0MS04 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRBV6-7A0A0A0MS04 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRBV6-7A0A0A0MS04 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRBV6-7A0A0A0MS04 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRBV6-7A0A0A0MS04 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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