Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR55

BATF3, Basic leucine zipper transcriptional factor ATF-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BATF3Q9NR55 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BATF3Q9NR55 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
BATF3Q9NR55 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BATF3Q9NR55 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BATF3Q9NR55 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BATF3Q9NR55 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BATF3Q9NR55 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BATF3Q9NR55 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BATF3Q9NR55 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BATF3Q9NR55 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BATF3Q9NR55 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BATF3Q9NR55 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BATF3Q9NR55 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BATF3Q9NR55 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BATF3Q9NR55 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BATF3Q9NR55 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
BATF3Q9NR55 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BATF3Q9NR55 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BATF3Q9NR55 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BATF3Q9NR55 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BATF3Q9NR55 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BATF3Q9NR55 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BATF3Q9NR55 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BATF3Q9NR55 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BATF3Q9NR55 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BATF3Q9NR55 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BATF3Q9NR55 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BATF3Q9NR55 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BATF3Q9NR55 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
BATF3Q9NR55 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BATF3Q9NR55 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BATF3Q9NR55 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BATF3Q9NR55 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BATF3Q9NR55 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BATF3Q9NR55 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
BATF3Q9NR55 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BATF3Q9NR55 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BATF3Q9NR55 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BATF3Q9NR55 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BATF3Q9NR55 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BATF3Q9NR55 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BATF3Q9NR55 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BATF3Q9NR55 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BATF3Q9NR55 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BATF3Q9NR55 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BATF3Q9NR55 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BATF3Q9NR55 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BATF3Q9NR55 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BATF3Q9NR55 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
BATF3Q9NR55 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BATF3Q9NR55 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BATF3Q9NR55 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BATF3Q9NR55 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BATF3Q9NR55 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BATF3Q9NR55 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BATF3Q9NR55 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
BATF3Q9NR55 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BATF3Q9NR55 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BATF3Q9NR55 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BATF3Q9NR55 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BATF3Q9NR55 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BATF3Q9NR55 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BATF3Q9NR55 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BATF3Q9NR55 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BATF3Q9NR55 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BATF3Q9NR55 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BATF3Q9NR55 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BATF3Q9NR55 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BATF3Q9NR55 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BATF3Q9NR55 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BATF3Q9NR55 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BATF3Q9NR55 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BATF3Q9NR55 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BATF3Q9NR55 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BATF3Q9NR55 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BATF3Q9NR55 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BATF3Q9NR55 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BATF3Q9NR55 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BATF3Q9NR55 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BATF3Q9NR55 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BATF3Q9NR55 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BATF3Q9NR55 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BATF3Q9NR55 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BATF3Q9NR55 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BATF3Q9NR55 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BATF3Q9NR55 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BATF3Q9NR55 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BATF3Q9NR55 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BATF3Q9NR55 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BATF3Q9NR55 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BATF3Q9NR55 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BATF3Q9NR55 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BATF3Q9NR55 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BATF3Q9NR55 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BATF3Q9NR55 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BATF3Q9NR55 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BATF3Q9NR55 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BATF3Q9NR55 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BATF3Q9NR55 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BATF3Q9NR55 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms