Protein–RNA interactions for Protein: Q9H300

PARL, Presenilins-associated rhomboid-like protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARLQ9H300 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PARLQ9H300 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PARLQ9H300 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PARLQ9H300 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PARLQ9H300 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PARLQ9H300 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PARLQ9H300 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PARLQ9H300 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PARLQ9H300 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PARLQ9H300 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PARLQ9H300 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PARLQ9H300 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PARLQ9H300 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PARLQ9H300 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PARLQ9H300 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PARLQ9H300 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PARLQ9H300 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PARLQ9H300 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PARLQ9H300 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PARLQ9H300 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PARLQ9H300 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PARLQ9H300 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PARLQ9H300 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PARLQ9H300 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PARLQ9H300 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PARLQ9H300 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PARLQ9H300 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PARLQ9H300 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PARLQ9H300 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PARLQ9H300 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PARLQ9H300 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PARLQ9H300 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PARLQ9H300 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PARLQ9H300 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PARLQ9H300 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PARLQ9H300 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PARLQ9H300 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PARLQ9H300 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PARLQ9H300 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PARLQ9H300 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PARLQ9H300 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PARLQ9H300 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PARLQ9H300 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PARLQ9H300 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PARLQ9H300 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PARLQ9H300 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PARLQ9H300 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PARLQ9H300 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PARLQ9H300 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PARLQ9H300 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PARLQ9H300 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PARLQ9H300 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PARLQ9H300 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PARLQ9H300 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PARLQ9H300 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PARLQ9H300 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PARLQ9H300 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PARLQ9H300 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PARLQ9H300 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PARLQ9H300 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PARLQ9H300 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PARLQ9H300 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PARLQ9H300 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PARLQ9H300 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PARLQ9H300 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PARLQ9H300 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PARLQ9H300 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PARLQ9H300 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PARLQ9H300 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PARLQ9H300 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PARLQ9H300 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PARLQ9H300 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PARLQ9H300 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PARLQ9H300 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PARLQ9H300 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PARLQ9H300 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PARLQ9H300 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PARLQ9H300 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PARLQ9H300 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PARLQ9H300 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PARLQ9H300 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PARLQ9H300 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PARLQ9H300 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PARLQ9H300 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PARLQ9H300 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PARLQ9H300 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PARLQ9H300 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PARLQ9H300 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PARLQ9H300 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PARLQ9H300 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PARLQ9H300 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PARLQ9H300 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PARLQ9H300 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PARLQ9H300 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PARLQ9H300 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PARLQ9H300 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PARLQ9H300 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PARLQ9H300 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PARLQ9H300 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PARLQ9H300 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms