Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRX5

GINS3, DNA replication complex GINS protein PSF3, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3Q9BRX5 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GINS3Q9BRX5 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms