Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ49

SMIM7, Small integral membrane protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM7Q9BQ49 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMIM7Q9BQ49 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM7Q9BQ49 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms