Protein–RNA interactions for Protein: Q99856

ARID3A, AT-rich interactive domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3AQ99856 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARID3AQ99856 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARID3AQ99856 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARID3AQ99856 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ARID3AQ99856 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARID3AQ99856 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARID3AQ99856 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARID3AQ99856 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARID3AQ99856 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARID3AQ99856 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARID3AQ99856 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARID3AQ99856 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARID3AQ99856 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARID3AQ99856 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARID3AQ99856 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARID3AQ99856 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARID3AQ99856 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARID3AQ99856 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARID3AQ99856 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARID3AQ99856 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARID3AQ99856 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARID3AQ99856 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARID3AQ99856 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARID3AQ99856 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARID3AQ99856 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARID3AQ99856 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ARID3AQ99856 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARID3AQ99856 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARID3AQ99856 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ARID3AQ99856 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARID3AQ99856 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARID3AQ99856 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARID3AQ99856 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARID3AQ99856 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARID3AQ99856 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARID3AQ99856 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARID3AQ99856 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARID3AQ99856 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARID3AQ99856 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARID3AQ99856 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARID3AQ99856 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARID3AQ99856 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARID3AQ99856 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARID3AQ99856 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARID3AQ99856 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ARID3AQ99856 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARID3AQ99856 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARID3AQ99856 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARID3AQ99856 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARID3AQ99856 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARID3AQ99856 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARID3AQ99856 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARID3AQ99856 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARID3AQ99856 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARID3AQ99856 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARID3AQ99856 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARID3AQ99856 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARID3AQ99856 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARID3AQ99856 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARID3AQ99856 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARID3AQ99856 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARID3AQ99856 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARID3AQ99856 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARID3AQ99856 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARID3AQ99856 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARID3AQ99856 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARID3AQ99856 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARID3AQ99856 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARID3AQ99856 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARID3AQ99856 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARID3AQ99856 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARID3AQ99856 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARID3AQ99856 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARID3AQ99856 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARID3AQ99856 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARID3AQ99856 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARID3AQ99856 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARID3AQ99856 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARID3AQ99856 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ARID3AQ99856 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARID3AQ99856 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARID3AQ99856 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARID3AQ99856 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARID3AQ99856 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARID3AQ99856 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARID3AQ99856 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ARID3AQ99856 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ARID3AQ99856 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARID3AQ99856 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARID3AQ99856 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARID3AQ99856 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARID3AQ99856 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARID3AQ99856 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARID3AQ99856 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARID3AQ99856 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARID3AQ99856 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARID3AQ99856 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ARID3AQ99856 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARID3AQ99856 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARID3AQ99856 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms