Protein–RNA interactions for Protein: Q99590

SCAF11, Protein SCAF11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF11Q99590 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SCAF11Q99590 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SCAF11Q99590 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SCAF11Q99590 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SCAF11Q99590 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SCAF11Q99590 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SCAF11Q99590 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SCAF11Q99590 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SCAF11Q99590 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SCAF11Q99590 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SCAF11Q99590 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SCAF11Q99590 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SCAF11Q99590 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SCAF11Q99590 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SCAF11Q99590 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
SCAF11Q99590 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SCAF11Q99590 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SCAF11Q99590 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SCAF11Q99590 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SCAF11Q99590 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SCAF11Q99590 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SCAF11Q99590 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SCAF11Q99590 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SCAF11Q99590 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SCAF11Q99590 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SCAF11Q99590 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SCAF11Q99590 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SCAF11Q99590 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SCAF11Q99590 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
SCAF11Q99590 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
SCAF11Q99590 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SCAF11Q99590 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SCAF11Q99590 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SCAF11Q99590 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SCAF11Q99590 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SCAF11Q99590 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
SCAF11Q99590 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SCAF11Q99590 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SCAF11Q99590 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SCAF11Q99590 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SCAF11Q99590 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SCAF11Q99590 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SCAF11Q99590 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SCAF11Q99590 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SCAF11Q99590 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SCAF11Q99590 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SCAF11Q99590 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SCAF11Q99590 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SCAF11Q99590 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SCAF11Q99590 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SCAF11Q99590 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SCAF11Q99590 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SCAF11Q99590 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SCAF11Q99590 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SCAF11Q99590 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SCAF11Q99590 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SCAF11Q99590 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SCAF11Q99590 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SCAF11Q99590 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
SCAF11Q99590 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SCAF11Q99590 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
SCAF11Q99590 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SCAF11Q99590 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SCAF11Q99590 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SCAF11Q99590 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SCAF11Q99590 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SCAF11Q99590 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SCAF11Q99590 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SCAF11Q99590 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SCAF11Q99590 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
SCAF11Q99590 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SCAF11Q99590 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SCAF11Q99590 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SCAF11Q99590 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SCAF11Q99590 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SCAF11Q99590 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SCAF11Q99590 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SCAF11Q99590 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SCAF11Q99590 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SCAF11Q99590 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SCAF11Q99590 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
SCAF11Q99590 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
SCAF11Q99590 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
SCAF11Q99590 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
SCAF11Q99590 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SCAF11Q99590 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
SCAF11Q99590 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SCAF11Q99590 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SCAF11Q99590 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SCAF11Q99590 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SCAF11Q99590 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SCAF11Q99590 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SCAF11Q99590 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SCAF11Q99590 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SCAF11Q99590 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SCAF11Q99590 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SCAF11Q99590 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SCAF11Q99590 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SCAF11Q99590 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
SCAF11Q99590 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms