Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMIGD2Q96BF3 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms