Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBXN4Q92575 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBXN4Q92575 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBXN4Q92575 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBXN4Q92575 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBXN4Q92575 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBXN4Q92575 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
UBXN4Q92575 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBXN4Q92575 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBXN4Q92575 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBXN4Q92575 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBXN4Q92575 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBXN4Q92575 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBXN4Q92575 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBXN4Q92575 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBXN4Q92575 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBXN4Q92575 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBXN4Q92575 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBXN4Q92575 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
UBXN4Q92575 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBXN4Q92575 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
UBXN4Q92575 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBXN4Q92575 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBXN4Q92575 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBXN4Q92575 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBXN4Q92575 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBXN4Q92575 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBXN4Q92575 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBXN4Q92575 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBXN4Q92575 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBXN4Q92575 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBXN4Q92575 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBXN4Q92575 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBXN4Q92575 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBXN4Q92575 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBXN4Q92575 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBXN4Q92575 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBXN4Q92575 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBXN4Q92575 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
UBXN4Q92575 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBXN4Q92575 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
UBXN4Q92575 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBXN4Q92575 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBXN4Q92575 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBXN4Q92575 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBXN4Q92575 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBXN4Q92575 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBXN4Q92575 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBXN4Q92575 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBXN4Q92575 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBXN4Q92575 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBXN4Q92575 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
UBXN4Q92575 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
UBXN4Q92575 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
UBXN4Q92575 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBXN4Q92575 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBXN4Q92575 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBXN4Q92575 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
UBXN4Q92575 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBXN4Q92575 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBXN4Q92575 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBXN4Q92575 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBXN4Q92575 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBXN4Q92575 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBXN4Q92575 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBXN4Q92575 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBXN4Q92575 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBXN4Q92575 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBXN4Q92575 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBXN4Q92575 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBXN4Q92575 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBXN4Q92575 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBXN4Q92575 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBXN4Q92575 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBXN4Q92575 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBXN4Q92575 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBXN4Q92575 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBXN4Q92575 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
UBXN4Q92575 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBXN4Q92575 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBXN4Q92575 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBXN4Q92575 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBXN4Q92575 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBXN4Q92575 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBXN4Q92575 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBXN4Q92575 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBXN4Q92575 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
UBXN4Q92575 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBXN4Q92575 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBXN4Q92575 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBXN4Q92575 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBXN4Q92575 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBXN4Q92575 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBXN4Q92575 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBXN4Q92575 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBXN4Q92575 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBXN4Q92575 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBXN4Q92575 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBXN4Q92575 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBXN4Q92575 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms