Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWF3

SSMEM1, Serine-rich single-pass membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSMEM1Q8WWF3 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSMEM1Q8WWF3 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSMEM1Q8WWF3 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SSMEM1Q8WWF3 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSMEM1Q8WWF3 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSMEM1Q8WWF3 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSMEM1Q8WWF3 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSMEM1Q8WWF3 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSMEM1Q8WWF3 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSMEM1Q8WWF3 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSMEM1Q8WWF3 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSMEM1Q8WWF3 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSMEM1Q8WWF3 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SSMEM1Q8WWF3 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSMEM1Q8WWF3 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSMEM1Q8WWF3 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSMEM1Q8WWF3 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSMEM1Q8WWF3 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSMEM1Q8WWF3 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSMEM1Q8WWF3 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSMEM1Q8WWF3 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSMEM1Q8WWF3 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSMEM1Q8WWF3 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSMEM1Q8WWF3 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSMEM1Q8WWF3 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSMEM1Q8WWF3 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSMEM1Q8WWF3 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSMEM1Q8WWF3 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSMEM1Q8WWF3 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SSMEM1Q8WWF3 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SSMEM1Q8WWF3 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSMEM1Q8WWF3 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSMEM1Q8WWF3 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSMEM1Q8WWF3 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSMEM1Q8WWF3 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSMEM1Q8WWF3 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSMEM1Q8WWF3 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSMEM1Q8WWF3 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSMEM1Q8WWF3 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSMEM1Q8WWF3 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSMEM1Q8WWF3 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSMEM1Q8WWF3 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSMEM1Q8WWF3 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSMEM1Q8WWF3 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSMEM1Q8WWF3 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSMEM1Q8WWF3 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSMEM1Q8WWF3 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSMEM1Q8WWF3 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSMEM1Q8WWF3 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSMEM1Q8WWF3 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSMEM1Q8WWF3 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSMEM1Q8WWF3 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSMEM1Q8WWF3 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSMEM1Q8WWF3 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSMEM1Q8WWF3 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSMEM1Q8WWF3 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSMEM1Q8WWF3 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSMEM1Q8WWF3 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSMEM1Q8WWF3 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSMEM1Q8WWF3 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSMEM1Q8WWF3 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSMEM1Q8WWF3 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSMEM1Q8WWF3 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSMEM1Q8WWF3 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSMEM1Q8WWF3 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SSMEM1Q8WWF3 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSMEM1Q8WWF3 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSMEM1Q8WWF3 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSMEM1Q8WWF3 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSMEM1Q8WWF3 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSMEM1Q8WWF3 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSMEM1Q8WWF3 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSMEM1Q8WWF3 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSMEM1Q8WWF3 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSMEM1Q8WWF3 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSMEM1Q8WWF3 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSMEM1Q8WWF3 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SSMEM1Q8WWF3 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSMEM1Q8WWF3 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSMEM1Q8WWF3 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSMEM1Q8WWF3 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSMEM1Q8WWF3 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSMEM1Q8WWF3 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSMEM1Q8WWF3 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSMEM1Q8WWF3 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSMEM1Q8WWF3 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSMEM1Q8WWF3 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSMEM1Q8WWF3 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSMEM1Q8WWF3 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSMEM1Q8WWF3 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSMEM1Q8WWF3 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SSMEM1Q8WWF3 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSMEM1Q8WWF3 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSMEM1Q8WWF3 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSMEM1Q8WWF3 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSMEM1Q8WWF3 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSMEM1Q8WWF3 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSMEM1Q8WWF3 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSMEM1Q8WWF3 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSMEM1Q8WWF3 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms