Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms