Protein–RNA interactions for Protein: Q14978

NOLC1, Nucleolar and coiled-body phosphoprotein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOLC1Q14978 APEX1-205ENST00000553555 1603 ntTSL 1 (best)14.95□□□□□ -0.023e-7■□□□□ 9.3
NOLC1Q14978 APEX1-201ENST00000216714 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.083e-7■□□□□ 9.3
NOLC1Q14978 APEX1-208ENST00000554813 654 ntTSL 314.48□□□□□ -0.093e-7■□□□□ 9.3
NOLC1Q14978 APEX1-211ENST00000555839 952 ntTSL 214.48□□□□□ -0.093e-7■□□□□ 9.3
NOLC1Q14978 APEX1-215ENST00000557150 740 ntTSL 313.43□□□□□ -0.263e-7■□□□□ 9.3
NOLC1Q14978 APEX1-212ENST00000556054 773 ntTSL 313.09□□□□□ -0.313e-7■□□□□ 9.3
NOLC1Q14978 APEX1-219ENST00000557365 831 ntTSL 313.09□□□□□ -0.313e-7■□□□□ 9.3
NOLC1Q14978 APEX1-202ENST00000398030 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.383e-7■□□□□ 9.3
NOLC1Q14978 APEX1-210ENST00000555414 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.383e-7■□□□□ 9.3
NOLC1Q14978 APEX1-220ENST00000557592 640 ntTSL 512.42□□□□□ -0.423e-7■□□□□ 9.3
NOLC1Q14978 APEX1-206ENST00000553681 899 ntTSL 312.27□□□□□ -0.453e-7■□□□□ 9.3
NOLC1Q14978 APEX1-203ENST00000438886 451 ntTSL 39.3□□□□□ -0.923e-7■□□□□ 9.3
NOLC1Q14978 APEX1-214ENST00000557054 888 ntTSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.083e-7■□□□□ 9.3
NOLC1Q14978 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.594e-16■□□□□ 9.3
NOLC1Q14978 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.044e-16■□□□□ 9.3
NOLC1Q14978 HNRNPA1-204ENST00000547276 1539 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.974e-16■□□□□ 9.3
NOLC1Q14978 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.922e-6■□□□□ 9.3
NOLC1Q14978 CPOX-203ENST00000512905 593 ntTSL 55.51□□□□□ -1.532e-6■□□□□ 9.3
NOLC1Q14978 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.978e-7■□□□□ 9.3
NOLC1Q14978 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.978e-7■□□□□ 9.3
NOLC1Q14978 IQGAP3-203ENST00000491900 5294 ntTSL 1 (best)13.4□□□□□ -0.266e-7■□□□□ 9.3
NOLC1Q14978 IQGAP3-201ENST00000361170 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.356e-7■□□□□ 9.3
NOLC1Q14978 OGT-201ENST00000373701 3310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.128e-7■□□□□ 9.3
NOLC1Q14978 OGT-210ENST00000488174 7243 ntTSL 57.4□□□□□ -1.238e-7■□□□□ 9.3
NOLC1Q14978 LGALS3BP-204ENST00000586720 1736 ntTSL 519■□□□□ 0.631e-13■□□□□ 9.3
NOLC1Q14978 LGALS3BP-205ENST00000587251 2091 ntTSL 518.94■□□□□ 0.621e-13■□□□□ 9.3
NOLC1Q14978 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.61e-13■□□□□ 9.3
NOLC1Q14978 LGALS3BP-207ENST00000587311 1905 ntTSL 218.47■□□□□ 0.551e-13■□□□□ 9.3
NOLC1Q14978 LGALS3BP-201ENST00000262776 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.061e-13■□□□□ 9.3
NOLC1Q14978 FUS-203ENST00000474990 827 ntTSL 324.77■■□□□ 1.562e-6■□□□□ 9.3
NOLC1Q14978 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.584e-11■□□□□ 9.3
NOLC1Q14978 DYNC1H1-204ENST00000555062 1351 ntTSL 220.21■□□□□ 0.833e-19■□□□□ 9.3
NOLC1Q14978 VTN-202ENST00000539746 609 ntTSL 212.85□□□□□ -0.355e-27■□□□□ 9.3
NOLC1Q14978 RPL24-203ENST00000469605 799 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.511e-14■□□□□ 9.3
NOLC1Q14978 RPL24-201ENST00000394077 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.981e-14■□□□□ 9.3
NOLC1Q14978 RPL24-202ENST00000464595 668 ntTSL 1 (best)8.81□□□□□ -11e-14■□□□□ 9.3
NOLC1Q14978 RPL24-206ENST00000495401 478 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.261e-14■□□□□ 9.3
NOLC1Q14978 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC4.15□□□□□ -1.756e-21■□□□□ 9.3
NOLC1Q14978 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.728e-9■□□□□ 9.3
NOLC1Q14978 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.698e-9■□□□□ 9.3
NOLC1Q14978 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.58e-9■□□□□ 9.3
NOLC1Q14978 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.418e-9■□□□□ 9.3
NOLC1Q14978 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.348e-9■□□□□ 9.3
NOLC1Q14978 SLC38A2-214ENST00000612232 1221 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.652e-9■□□□□ 9.2
NOLC1Q14978 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC2.3□□□□□ -2.041e-323■□□□□ 9.2
NOLC1Q14978 TKFC-217ENST00000533393 597 ntTSL 525.2■■□□□ 1.624e-9■□□□□ 9.2
NOLC1Q14978 TKFC-214ENST00000530456 589 ntTSL 222.99■■□□□ 1.274e-9■□□□□ 9.2
NOLC1Q14978 TKFC-210ENST00000529479 1781 ntTSL 1 (best)22.76■■□□□ 1.234e-9■□□□□ 9.2
NOLC1Q14978 HLA-B-255ENST00000498007 1087 nt21.68■■□□□ 1.064e-9■□□□□ 9.2
NOLC1Q14978 EPCAM-203ENST00000419334 609 ntTSL 319.33■□□□□ 0.684e-9■□□□□ 9.2
NOLC1Q14978 TKFC-216ENST00000532173 805 ntTSL 219.16■□□□□ 0.664e-9■□□□□ 9.2
NOLC1Q14978 TKFC-208ENST00000529092 332 ntTSL 318.43■□□□□ 0.544e-9■□□□□ 9.2
NOLC1Q14978 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.134e-9■□□□□ 9.2
NOLC1Q14978 HLA-B-251ENST00000463574 588 nt13.69□□□□□ -0.224e-9■□□□□ 9.2
NOLC1Q14978 GLG1-205ENST00000561942 674 ntTSL 28.1□□□□□ -1.114e-9■□□□□ 9.2
NOLC1Q14978 C5-204ENST00000480188 619 ntTSL 25.29□□□□□ -1.564e-9■□□□□ 9.2
NOLC1Q14978 PHF1-208ENST00000486845 1099 ntTSL 521.88■■□□□ 1.099e-9■□□□□ 9.2
NOLC1Q14978 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.019e-9■□□□□ 9.2
NOLC1Q14978 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.819e-9■□□□□ 9.2
NOLC1Q14978 PHF1-207ENST00000479029 933 ntTSL 218.18■□□□□ 0.59e-9■□□□□ 9.2
NOLC1Q14978 PHF1-211ENST00000495509 1752 ntTSL 217.09■□□□□ 0.339e-9■□□□□ 9.2
NOLC1Q14978 PHF1-204ENST00000427826 862 ntTSL 316.6■□□□□ 0.259e-9■□□□□ 9.2
NOLC1Q14978 CD164-204ENST00000413644 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.29e-9■□□□□ 9.2
NOLC1Q14978 CD164-202ENST00000310786 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.479e-9■□□□□ 9.2
NOLC1Q14978 CD164-203ENST00000324953 2936 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.549e-9■□□□□ 9.2
NOLC1Q14978 CD164-201ENST00000275080 2954 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.669e-9■□□□□ 9.2
NOLC1Q14978 CD164-205ENST00000415861 4963 ntTSL 1 (best)4.52□□□□□ -1.699e-9■□□□□ 9.2
NOLC1Q14978 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.952e-12■□□□□ 9.2
NOLC1Q14978 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.132e-12■□□□□ 9.2
NOLC1Q14978 C3-210ENST00000598805 873 ntTSL 216.04■□□□□ 0.166e-44■□□□□ 9.2
NOLC1Q14978 LINC00888-201ENST00000468380 1241 ntTSL 220.31■□□□□ 0.843e-43■□□□□ 9.2
NOLC1Q14978 LINC00888-202ENST00000471496 1490 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.243e-43■□□□□ 9.2
NOLC1Q14978 LINC00888-204ENST00000487386 421 ntBASIC5.94□□□□□ -1.463e-43■□□□□ 9.2
NOLC1Q14978 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.245e-6■□□□□ 9.2
NOLC1Q14978 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.115e-6■□□□□ 9.2
NOLC1Q14978 AP2A1-208ENST00000601356 2238 nt27.14■■□□□ 1.943e-14■□□□□ 9.2
NOLC1Q14978 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.795e-6■□□□□ 9.2
NOLC1Q14978 DAZAP1-204ENST00000586579 619 ntTSL 324.82■■□□□ 1.565e-6■□□□□ 9.2
NOLC1Q14978 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.955e-6■□□□□ 9.2
NOLC1Q14978 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.835e-6■□□□□ 9.2
NOLC1Q14978 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.85e-6■□□□□ 9.2
NOLC1Q14978 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.695e-6■□□□□ 9.2
NOLC1Q14978 YKT6-202ENST00000421621 2463 ntTSL 1 (best)18.97■□□□□ 0.635e-6■□□□□ 9.2
NOLC1Q14978 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.615e-6■□□□□ 9.2
NOLC1Q14978 DAZAP1-210ENST00000592453 1021 ntTSL 516.42■□□□□ 0.225e-6■□□□□ 9.2
NOLC1Q14978 DAZAP1-209ENST00000590419 508 ntTSL 315.92■□□□□ 0.145e-6■□□□□ 9.2
NOLC1Q14978 GGA3-220ENST00000613421 5156 ntTSL 215.87■□□□□ 0.135e-6■□□□□ 9.2
NOLC1Q14978 RTN3-210ENST00000540798 3124 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.125e-6■□□□□ 9.2
NOLC1Q14978 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.067e-10■□□□□ 9.2
NOLC1Q14978 CCNB2-201ENST00000288207 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.027e-10■□□□□ 9.2
NOLC1Q14978 RTN3-203ENST00000341307 2524 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.15e-6■□□□□ 9.2
NOLC1Q14978 RTN3-207ENST00000536011 992 ntTSL 214.37□□□□□ -0.115e-6■□□□□ 9.2
NOLC1Q14978 AP2A1-201ENST00000354293 3388 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.123e-14■□□□□ 9.2
NOLC1Q14978 AP2A1-202ENST00000359032 3286 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.23e-14■□□□□ 9.2
NOLC1Q14978 AL512356.1-201ENST00000548203 535 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.25e-6■□□□□ 9.2
NOLC1Q14978 NSA2-201ENST00000296802 1199 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.225e-6■□□□□ 9.2
NOLC1Q14978 GGA3-205ENST00000578348 2251 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.245e-6■□□□□ 9.2
NOLC1Q14978 SRP72-201ENST00000342756 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.35e-6■□□□□ 9.2
NOLC1Q14978 RTN3-208ENST00000537981 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.35e-6■□□□□ 9.2
NOLC1Q14978 GGA3-213ENST00000582486 2319 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.415e-6■□□□□ 9.2
Retrieved 100 of 7,921 protein–RNA pairs in 431.1 ms