RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486845.1

PHF1-208, Transcript of PHD finger protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene PHF1, Length 1,099 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF1-208ENST00000486845 NISCHQ9Y2I1 1504 aa50.66■■■■■ 5.7
PHF1-208ENST00000486845 ABCC9O60706 1549 aa45.78■■■■■ 4.92
PHF1-208ENST00000486845 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa45.61■■■■■ 4.89
PHF1-208ENST00000486845 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa43.53■■■■■ 4.56
PHF1-208ENST00000486845 NACADO15069 1562 aa43.17■■■■■ 4.5
PHF1-208ENST00000486845 DNAJC5BQ9UF47 199 aa43.11■■■■■ 4.49
PHF1-208ENST00000486845 DCAF8L2P0C7V8 631 aa42.8■■■■■ 4.44
PHF1-208ENST00000486845 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP42.55■■■■■ 4.45e-8■■■□□ 18.8
PHF1-208ENST00000486845 MYO15BQ96JP2 1530 aa42.51■■■■■ 4.4
PHF1-208ENST00000486845 UNC13AQ9UPW8 1703 aa42.49■■■■■ 4.39
PHF1-208ENST00000486845 BICRAQ9NZM4 1560 aa42.22■■■■■ 4.35
PHF1-208ENST00000486845 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP41.94■■■■■ 4.3
PHF1-208ENST00000486845 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa41.87■■■■■ 4.29
PHF1-208ENST00000486845 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa41.72■■■■■ 4.27
PHF1-208ENST00000486845 SCRIBQ14160 1630 aa41.5■■■■■ 4.23
PHF1-208ENST00000486845 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa41.36■■■■■ 4.21
PHF1-208ENST00000486845 CECR2Q9BXF3 1484 aa41.29■■■■■ 4.2
PHF1-208ENST00000486845 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP41.23■■■■■ 4.19
PHF1-208ENST00000486845 NCAPD3P42695 1498 aa39.83■■■■□ 3.97
PHF1-208ENST00000486845 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa39.83■■■■□ 3.97
PHF1-208ENST00000486845 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa39.67■■■■□ 3.94
PHF1-208ENST00000486845 CUX2O14529 1486 aa39.62■■■■□ 3.93
PHF1-208ENST00000486845 ERCC6Q03468 1493 aa39.59■■■■□ 3.93
PHF1-208ENST00000486845 SMARCA2P51531 1590 aa39.59■■■■□ 3.93
PHF1-208ENST00000486845 SMARCA4P51532 1647 aa39.58■■■■□ 3.93
PHF1-208ENST00000486845 HMGXB3Q12766 1538 aa39.55■■■■□ 3.92
PHF1-208ENST00000486845 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP39.37■■■■□ 3.89
PHF1-208ENST00000486845 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP39.29■■■■□ 3.88
PHF1-208ENST00000486845 NESP48681 1621 aa39.25■■■■□ 3.87
PHF1-208ENST00000486845 PEG3Q9GZU2 1588 aa39.21■■■■□ 3.87
PHF1-208ENST00000486845 MROH2BQ7Z745 1585 aa39■■■■□ 3.83
PHF1-208ENST00000486845 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa39■■■■□ 3.83
PHF1-208ENST00000486845 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP38.95■■■■□ 3.83
PHF1-208ENST00000486845 PDS5BQ9NTI5 1447 aa38.78■■■■□ 3.8
PHF1-208ENST00000486845 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa38.77■■■■□ 3.8
PHF1-208ENST00000486845 CADPSQ9ULU8 1353 aa38.6■■■■□ 3.77
PHF1-208ENST00000486845 WIZO95785 1651 aa38.52■■■■□ 3.76
PHF1-208ENST00000486845 MRC2Q9UBG0 1479 aa38.46■■■■□ 3.75
PHF1-208ENST00000486845 WDR62O43379 1518 aa38.37■■■■□ 3.73
PHF1-208ENST00000486845 CEP164Q9UPV0 1460 aa38.26■■■■□ 3.72
PHF1-208ENST00000486845 FANCD2Q9BXW9 1451 aa38.17■■■■□ 3.7
PHF1-208ENST00000486845 CFTRP13569 1480 aa38.12■■■■□ 3.69
PHF1-208ENST00000486845 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP38.12■■■■□ 3.69
PHF1-208ENST00000486845 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP38.07■■■■□ 3.68
PHF1-208ENST00000486845 TRIM41Q8WV44 630 aa37.96■■■■□ 3.67
PHF1-208ENST00000486845 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP37.87■■■■□ 3.65
PHF1-208ENST00000486845 PRDM2Q13029 1718 aa37.75■■■■□ 3.63
PHF1-208ENST00000486845 OSCARQ8IYS5 282 aa37.73■■■■□ 3.63
PHF1-208ENST00000486845 CCDC88BA6NC98 1476 aa37.59■■■■□ 3.61
PHF1-208ENST00000486845 IFT140Q96RY7 1462 aa37.51■■■■□ 3.59
PHF1-208ENST00000486845 TOPBP1Q92547 1522 aa37.42■■■■□ 3.58
PHF1-208ENST00000486845 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP37.42■■■■□ 3.58
PHF1-208ENST00000486845 ABCC8Q09428 1581 aa37.37■■■■□ 3.57
PHF1-208ENST00000486845 DNMBPQ6XZF7 1577 aa37.28■■■■□ 3.56
PHF1-208ENST00000486845 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa37.28■■■■□ 3.56
PHF1-208ENST00000486845 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa37.28■■■■□ 3.56
PHF1-208ENST00000486845 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa37.28■■■■□ 3.56
PHF1-208ENST00000486845 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP37.24■■■■□ 3.55
PHF1-208ENST00000486845 ARHGEF11O15085 1522 aa37.14■■■■□ 3.54
PHF1-208ENST00000486845 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP37.1■■■■□ 3.53
PHF1-208ENST00000486845 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP37.05■■■■□ 3.529e-8■■■■□ 19.4
PHF1-208ENST00000486845 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP37.01■■■■□ 3.52
PHF1-208ENST00000486845 CHD1O14646 1710 aa37■■■■□ 3.51
PHF1-208ENST00000486845 FBLN2P98095 1184 aa36.86■■■■□ 3.49
PHF1-208ENST00000486845 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa36.86■■■■□ 3.49
PHF1-208ENST00000486845 CYB5RLQ6IPT4 315 aa36.84■■■■□ 3.49
PHF1-208ENST00000486845 SOGA1O94964 1423 aa36.84■■■■□ 3.49
PHF1-208ENST00000486845 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP36.78■■■■□ 3.48
PHF1-208ENST00000486845 WDR97A6NE52 1622 aa36.77■■■■□ 3.48
PHF1-208ENST00000486845 FGD5Q6ZNL6 1462 aa36.75■■■■□ 3.47
PHF1-208ENST00000486845 ARAP1Q96P48 1450 aa36.75■■■■□ 3.47
PHF1-208ENST00000486845 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa36.69■■■■□ 3.46
PHF1-208ENST00000486845 CUX1P39880 1505 aa36.68■■■■□ 3.46
PHF1-208ENST00000486845 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP36.62■■■■□ 3.45
PHF1-208ENST00000486845 CLASP1Q7Z460 1538 aa36.59■■■■□ 3.45
PHF1-208ENST00000486845 GRIN2BQ13224 1484 aa36.58■■■■□ 3.45
PHF1-208ENST00000486845 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP36.57■■■■□ 3.44
PHF1-208ENST00000486845 SYNJ1O43426 1573 aa36.56■■■■□ 3.44
PHF1-208ENST00000486845 TRHP20396 242 aaPredicted RBP36.53■■■■□ 3.44
PHF1-208ENST00000486845 SYNJ2O15056 1496 aa36.49■■■■□ 3.43
PHF1-208ENST00000486845 PBRM1Q86U86 1689 aa36.41■■■■□ 3.42
PHF1-208ENST00000486845 GAPVD1Q14C86 1478 aa36.4■■■■□ 3.42
PHF1-208ENST00000486845 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa36.34■■■■□ 3.41
PHF1-208ENST00000486845 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa36.3■■■■□ 3.4
PHF1-208ENST00000486845 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP36.2■■■■□ 3.39
PHF1-208ENST00000486845 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP36.15■■■■□ 3.38
PHF1-208ENST00000486845 GRIN2AQ12879 1464 aa36.1■■■■□ 3.37
PHF1-208ENST00000486845 ADAMTS12P58397 1594 aa36.06■■■■□ 3.36
PHF1-208ENST00000486845 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa36.05■■■■□ 3.36
PHF1-208ENST00000486845 TOP2BQ02880 1626 aa36.04■■■■□ 3.36
PHF1-208ENST00000486845 NUP160Q12769 1436 aa35.99■■■■□ 3.35
PHF1-208ENST00000486845 CEP170Q5SW79 1584 aa35.97■■■■□ 3.35
PHF1-208ENST00000486845 ERCC6L2Q5T890 1561 aa35.94■■■■□ 3.34
PHF1-208ENST00000486845 FHAD1B1AJZ9 1412 aa35.94■■■■□ 3.34
PHF1-208ENST00000486845 ERICH3Q5RHP9 1530 aa35.89■■■■□ 3.34
PHF1-208ENST00000486845 SHROOM2Q13796 1616 aa35.86■■■■□ 3.33
PHF1-208ENST00000486845 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP35.67■■■■□ 3.3
PHF1-208ENST00000486845 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP35.66■■■■□ 3.3
PHF1-208ENST00000486845 JPH4Q96JJ6 628 aa35.59■■■■□ 3.29
PHF1-208ENST00000486845 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa35.56■■■■□ 3.28
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