Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHD4Q14839 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHD4Q14839 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHD4Q14839 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHD4Q14839 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHD4Q14839 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHD4Q14839 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CHD4Q14839 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHD4Q14839 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHD4Q14839 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHD4Q14839 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHD4Q14839 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHD4Q14839 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHD4Q14839 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHD4Q14839 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHD4Q14839 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHD4Q14839 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHD4Q14839 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHD4Q14839 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHD4Q14839 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHD4Q14839 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHD4Q14839 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHD4Q14839 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHD4Q14839 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHD4Q14839 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHD4Q14839 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHD4Q14839 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHD4Q14839 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHD4Q14839 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CHD4Q14839 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHD4Q14839 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHD4Q14839 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHD4Q14839 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHD4Q14839 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHD4Q14839 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHD4Q14839 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHD4Q14839 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CHD4Q14839 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHD4Q14839 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHD4Q14839 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHD4Q14839 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHD4Q14839 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHD4Q14839 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHD4Q14839 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHD4Q14839 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHD4Q14839 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHD4Q14839 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHD4Q14839 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHD4Q14839 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHD4Q14839 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHD4Q14839 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHD4Q14839 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHD4Q14839 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHD4Q14839 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHD4Q14839 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHD4Q14839 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHD4Q14839 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHD4Q14839 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHD4Q14839 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHD4Q14839 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CHD4Q14839 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CHD4Q14839 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHD4Q14839 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CHD4Q14839 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHD4Q14839 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CHD4Q14839 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHD4Q14839 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHD4Q14839 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHD4Q14839 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHD4Q14839 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHD4Q14839 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHD4Q14839 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHD4Q14839 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHD4Q14839 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHD4Q14839 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHD4Q14839 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHD4Q14839 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CHD4Q14839 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHD4Q14839 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHD4Q14839 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHD4Q14839 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHD4Q14839 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHD4Q14839 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHD4Q14839 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHD4Q14839 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
CHD4Q14839 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHD4Q14839 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHD4Q14839 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHD4Q14839 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHD4Q14839 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHD4Q14839 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHD4Q14839 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHD4Q14839 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHD4Q14839 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHD4Q14839 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHD4Q14839 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHD4Q14839 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHD4Q14839 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHD4Q14839 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHD4Q14839 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
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